کاربرد نشانگرهای ریزماهواره جهت شناسایی و ثبت ارقام زیتون

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 454

فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOPP-23-1_002

تاریخ نمایه سازی: 26 اردیبهشت 1400

چکیده مقاله:

سابقه و هدف: زیتون شامل تقریبا ۲۰ گونه درختان کوچک از خانواده Oleaceae بوده و در جهان کهن از حوزه دریای مدیترانه، شمال افریقا، جنوب شرقی آسیا، شمال تا جنوب چین، اسکاتلند و شرق استرالیا پراکندگی گسترده ای داشته اند. آنها همیشه سبز بوده و دارای برگهایی کوچک و یکپارچه هستند که روبروی هم قرار گرفته اند. میوه این گیاه یک شفت می باشد درخت زیتون به دلیل مقاومت به کم آبی و سازگاری با خاک های کم بازده و فقیر و تولید محصول با ارزش کم هزینه، از نظر اقتصادی بسیار حائز اهمیت بوده که به محصول ثروتمند خاک های فقیر مشهور است. در گذشته، روش های شناسایی ارقام مبتنی بر خصوصیات مورفولوژیکی برگ، میوه، هسته و مغز هسته استوار بود، ولی جز در موارد خاص استفاده از صفات مورفولوژیک به تنهائی برای شناسایی ارقام کافی نمی باشد با توجه به شناسایی پیچیده ارقام زیتون با استفاده از صفات موفولوژیکی ابزار مولکولی چشم انداز جدید برای انگشت نگاری DNA فراهم کرده اند در سال­های اخیر تکنولوژی نشانگرهای DNA در گیاهان عالی، به سمت استفاده از این نشانگرها در انگشت نگاری DNA سوق یافته است. مواد و روش ها: انجام نمونه برداری پس از دریافت اطلاعات از موسسه ثبت و گواهی بذرو موسسه تحقیقات علوم باغبانی  صورت گرفت نمونه گیری از سربرگ­های جوان و تازه رشد کرده درخت به صورت سرشاخه انجام شد.۳۰ میلی گرم از برگ توسط ازت کوبیده شده و استخراج DNA با استفاده از کیت استخراج DNA ساخت شرکت Core Bio و بر پایه دستور العمل کیت انجام گردید در این تحقیق مجموعا از ۲۲ نشانگر ریز ماهواره استفاده شد یافته ها:  در این تحقیق با استفاده از ۲۲ نشانگر مولکولی SSR، کلید شناسایی مولکولی ۱۱ رقم زیتون (L. (Olea europaea حاصل گردید. نتایج نشان داد ۱۰ نشانگر ریز ماهواره از بین نشانگرهای بکار رفته در ۱۱ رقم مورد مطالعه نوارهای چند شکل ایجاد نمودند. نشانگرهای MOL ۱ در رقم تخم کبکی، MOL ۷ در رقم های دزفولی، ماوی و روغنی، MOL ۸ در رقم دزفولی و شنگه، MOL ۹ در رقم­های دزفولی، گلوله، ماری و روغنی، MOL ۱۰ در رقم تخم کبکی، MOL ۱۱ در رقم­های دزفولی و فیشومی، MOL ۱۴ در رقم دهقان، MOL ۱۸ در رقم گلوله و MOL ۲۰ در رقم ماری ایجاد باندهای چند شکل اختصاصی نمودند. از میان نشانگرهای مورد استفاده، نشانگرMOL ۹ به تنهایی قادر به شناسایی و تفکیک چهار رقم مهم زیتون ایران شامل دزفولی، گلوله، ماری و روغنی از سایر ارقام مورد مطالعه بود. نتیجه گیری: تجزیه خوشه­ای به منظور شناسایی درختان مادری خارج از تیپ در بین درختان مادری یک رقم انجام شد کلید های مولکولی اختصاصی بوسیله تجزیه های مولکولی بر روی ۶۴ درخت مادری ارقام مورد مطالعه، شناسایی و در دو آزمایشگاه مولکولی مستقل واقع در پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی و موسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال تایید شد. اکثر درختان مادری ارقام مختلف در گروه های مجزا طبقه بندی شدند با مشاهده دندروگرام حاصل از نرم افزار SplitsTree ۴، درختان مادری ارقام مورد مطالعه زیتون با استفاده از ۱۱ نشانگر SSR چند شکل نشان داد، اکثر درختان مادری ارقام مختلف در گروه های مجزا طبقه بندی شدندنتایج حاصل از ارتباط ژنتیکی بدست آمده با استفاده از روش مبتنی بر مدل و روش خوشه ای بسیار مشابه هم بودند با شناسایی کلید­های شناسایی مولکولی ارقام مورد مطالعه، امکان تشخیص این ارقام به منظور تایید اصالت ژنتیکی آنها میسر گردید.

کلیدواژه ها:

انگشت نگاری ریز ماهواره ، تجزیه خوشه ای ، روش های مبتنی بر مدل ، زیتون