ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

تجزیه ساختار و تنوع ژنتیکی آفتابگردان روغنی (Helianthus annuus L.) بر اساس نشانگرهای ریزماهواره

محل انتشار: مجله پژوهش های ژنتیک گیاهی، دوره: 2، شماره: 2
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 411

فایل این مقاله در 18 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1162772

شناسه ملی سند علمی:

JR_PGRLU-2-2_002

تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399

چکیده مقاله:

آگاهی از میزان تنوع ژنتیکی و درک روابط موجود بین ژنوتیپ ها گام مؤثری در راستای حفظ ژرم پلاسم و طراحی برنامه های اصلاحی در گیاهان است. در این مطالعه تنوع ژنتیکی 106 لاین مختلف آفتابگردان روغنی با 30 جفت آغازگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. در مجموع 71 آلل در لاین های مورد مطالعه شناسایی شدند. تعداد آلل ها در مکان های ریزماهواره بین 2 تا 4 عدد متغیر و میانگین تعداد آلل در هر مکان ریزماهواره 207/2 بود. دامنه تعداد آلل موثر از 06/1 در مکان ژنی ORS718 تا 15/3 در مکان ژنیHA3040  متغیر بود. میانگین تعداد آلل موثر برابر 64/1 برآورد شد. میانگین محتوی اطلاعات چندشکلی (PIC) برابر 344/0 به دست آمد. با توجه به میزان PIC و تعداد آلل، می‌توان بیان نمود که آغازگرهای HA3040‎ و ORS733‎، مناسب ترین آغازگرها برای بررسی تنوع ژنتیکی و تمایز ژنوتیپ ها می‌باشند. بر اساس ضریب همبستگی کوفنتیک (46/0r=) مناسب ترین روش برای گروه‌بندی لاین‌های مورد مطالعه، گروه‌بندی بر اساس ضریب تشابه جاکارد با الگوریتم Complete بود. بر اساس این گروه بندی لاین های مورد بررسی در 4 گروه قرار گرفتند. 96 لاین از 106 ژنوتیپ استفاده شده بر اساس مراکز تحقیقاتی مبدا، گروه‌بندی شدند. کمترین فاصله ژنتیکی نی برابر 004/0 بین گروه SPII با ENSAT و INRA-MONTPOL مشاهده شد و بیشترین آن 210/0 بین دو گروه NOVARTIS و HUNGARY مشاهده شد. تجزیه ساختار جمعیت نشان داد به احتمال قوی جمعیت مورد مطالعه دارای 5 زیرساختار می باشد. بررسی انتساب لاین‌ها به زیرساختار‌ها الگوی خاصی از جمله توزیع جغرافیایی را نشان نداد. از تنوع ژنتیکی و فاصله ژنتیکی که با استفاده از نشانگرهای SSR به دست آمد، میتوان بطور مطلوب در برنامه های تلاقی و بهنژادی آفتابگردان روغنی استفاده کرد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

فاطمه صحرانورد آذرتمر

Former M.Sc. Student, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran

مرتضی قدیم زاده

Associate Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran

رضا درویشزاده

Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Basirnia, A., Darvishzadeh, R. and Abdollahi Mandoulakani, B. (2016). Retrotransposoninsertional ...
  • Cheres, M.T. and Knapp, S.J. (1998). Ancestral origins and genetic ...
  • Darvishzadeh, R. (2012). Phenotypic and molecular marker distance as a ...
  • Darvishzadeh, R., Azizi, M., Hatami-Maleli, H., Bernusi, I., Abdollahi Mandoulakani, ...
  • Dellaporta, S.L., Wood, J. and Hicks, J.B. (1983). A plant ...
  • Diz, P.A. and Presa, P. (2009). The genetic diversity pattern ...
  • Dong, G.J., Liu, G.S. and Li, K.F. (2007). Studying genetic ...
  • Dry, P.J. and Burdon, J.J. (1986). Genetic structure of natural ...
  • Eathing, S.R., Crosbie, T.M., Edwards, M.D., Reiter, R.S. and Bull, ...
  • Ebrahimi, M. and Zinoabedini, M. (2013). Application of genomic and ...
  • Evanno, G., Regnaut, S. and Goudet, J. (2005). Detecting the ...
  • Fick G.N. and Zimmer, D.E. (1974). Parental lines for production ...
  • Fick, G.N. (1989). Sunflower. pp. 301-318, In: G. Robbelen, R.K. ...
  • Gabor, T., Gasper, Z. and Jurka, J. (2000). Microsatellite in ...
  • Galaev, A.V., Babayants, L.T. and Sivolap Yu., M. (2006). DNA-markers ...
  • Garayalde, A.F., Poverene, M., Cantamutto, M. and Carrera, A.D. (2011). ...
  • Gharghani, A., Zamani, Z., Talaie, A., Oraguzie, N.C., Fatahi, R., ...
  • Heiser, C.B. (1976). Sunflowers: Helianthus (Compositae- Heliantheae). pp. 36-38, In: ...
  • Hu, J., Seiler, G. and Kole, C. (2010). Genetics, Genomics ...
  • Iqbal, M.A., Sadaqat, H.A. and Khan, I.A. (2008). Estimation of ...
  • Kalia, R.K., Rai, M.K., Kalia, S., Singh, R. and Dhawan, ...
  • Khelestkina E.K., Pestsova, E.G., Salina, E., Roder, M.S., Abruzova, V.S., ...
  • Kholghi M., Darvishzadeh, R., Bernousi, I., Pirzad, A. and Laurentin, ...
  • Kubo, N., Hirai, M., Kaneko, A., Tanaka, D. and Kasumi, ...
  • Laurentin H. (2009). Data analysis for molecular characterization of plant ...
  • Li Y.C., Korol, A.B., Fahima, T. and Nevo, E. (2004). ...
  • Liu, Z. (2007). Aquaculture Genome Technologies. Blackwell Publishing. Morgante, M., ...
  • Mondini, L., Noorani, A. and Pagnotta, M.A. (2009). Assessing plant ...
  • Muller, M.E., Delieux, F., Fernandez Martınez, J.M., Garric, B., Lecomte, ...
  • Naseri, L., Darvishzadeh, R., Mohseniazar, M. and Alizadeh, A. (2011). ...
  • Nei, M. (1978). Estimation of average heterozygosity and genetic distance ...
  • Paniego N., Muñoz, M., Echaide, M., Fernandez, L., Faccio, P., ...
  • Paniego, N., Echaide, M., Munoz, M., Fernandez, L., Torales, S., ...
  • Paniego, N., Heinz, R., Fernandez, P., Talia, P., Nishinakamasu, V. ...
  • Peakall, R. and Smouse, P.E. (2006). GenAlEx 6: Genetic Analysis ...
  • Piñera, J.A., Blanco, G., Vázquez, E. and Sánchez, J.A. (2007). ...
  • Poormohammad Kiani, S., Talia, P., Maury, P., Grieu, P., Heinz, ...
  • Pritchard J.K., Stephens, M. and Donnelly, P. (2000). Inference of ...
  • Rincon, F., Johnson, B., Crossa, J. and Taba, S. (1996). ...
  • Rohlf F.J. (1998). NTSYSpc: Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System. ...
  • Rosenberg N.A., Pritchard, J.K., Weber, J.L., Cann, H.M., Kidd, K.K., ...
  • Sabzalian M.R., Mirlohi, A.F., Saeidi, G. and Rabbani, M.T. (2009). ...
  • Tang, S. and Knapp S. J. (2003). Microsatellites uncover extraordinary ...
  • Tang, S., Yu, J.K., Slabaagh, M.B., Shintani, D.K. and Knapp, ...
  • Thormann, C.E., Ferreira, M.E., Camargo, L.E.A., Tivang, J.G. and Osborn, ...
  • Varshney R.K., Graner, A. and Sorrells, M.E. (2005). Genic microsatellite ...
  • Vienne, D. (2003). Molecular Markers in Plants Genetics and Biotechnology. ...
  • Weber, J.J. (1990). Informativeness of human (dC-dA) n (dG.dT)n polymorphisms. ...
  • Wright, S. (1951). The genetical structure of populations. Annals of ...
  • Yu, J.K., Mangor, J., Thompson, L., Edwards, K.J., Slabaugh, M.B. ...
  • Zhang, L.S., Le Clerc, V., Li, S. and Zhang, D. ...
    • نمایش کامل مراجع