انتقال پذیری نشانگرهای ریزماهواره جو برای ارزیابی روابط ژنتیکی در خویشاوندان وحشی گندم جنس‌های Triticum و Aegilops

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 336

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AGRO-22-2_004

تاریخ نمایه سازی: 1 اسفند 1399

چکیده مقاله:

ژنومیک مقایسه­ای هم‌خطی بین ژنوم گونه­های خویشاوند نزدیک گیاهی را با دقت بالایی نشان داده و امکان تبادل نشانگرها بین آن­ها را فراهم می‌سازد. هدف این تحقیق ارزیابی انتقال­پذیری نشانگرهای ریزماهواره جو بین گونه­های جنس­های Triticum و Aegilops برای تعیین روابط ژنتیکی آن­ها بود. آزمایش در سال 1395در دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز انجام شد.  از 165 جفت آغازگر ریزماهواره جو مورد بررسی در 40 ژنوتیپ از نه گونه از جنس‌­های Triticum و Aegilops، 62 جفت آغازگر  (5/37 درصد) در ژنوم یکی از گونه­های مورد مطالعه تکثیر موفق داشت و 50 جفت آغازگر (3/30 درصد) الگوی نواری چند شکل ایجاد کردند. با استفاده از 50 جفت آغازگر چند شکل، 223 آلل با دامنه 2 تا 14 و میانگین 46/4 الل به ازای هر جایگاه تکثیر شد. میانگین اطلاعات چند شکلی و تنوع ژنی به ترتیب 55/0 و 60/0 برآورد شد. ژنوتیپ­های مورد مطالعه با استفاده الگوریتم تجزیه خوشه­ای و ضریب فاصله تکاملی به چهار گروه تفکیک شدند. گونه­های جنس­های Triticum و Aegilops در دو گروه جداگانه قرار گرفته و در داخل هر جنس نیز گروه­بندی با ساختار ژنوم آن­ها تطابق داشت. در تجزیه به بردارهای اصلی، دو بردار اصلی اول به ترتیب 6/24 و 8/21 درصد از تنوع مولکولی را توجیه کردند و توزیع ژنوتیپ­ها براساس این دو بردار با گروه­بندی تجزیه خوشه­ای مطابقت داشت. نتایج این آزمایش نشان داد که از نشانگرهای انتقال­پذیر جو می­توان با موفقیت در مطالعات ژنتیکی و به­نژادی در گندم و خویشاوندان آن استفاده کرد.

کلیدواژه ها:

Barley ، Genetic diversity ، SSR markers ، Transferability and Wheat wild relatives ، انتقال‌پذیری ، تنوع ژنتیکی ، جو ، خویشاوندان وحشی گندم و نشانگرهای ریزماهواره.

نویسندگان

احمد احمدی لکی

University of Tabriz, Tabriz, Iran

سید ابوالقاسم محمدی

University of Tabriz, and Center of Excellence in Cereals Molecular Breeding, University of Tabriz, Tabriz, Iran

محمد مقدم

University of Tabriz, and Center of Excellence in Cereals Molecular Breeding, University of Tabriz, Tabriz, Iran

مصطفی ولیزاده

University of Tabriz, and Center of Excellence in Cereals Molecular Breeding, University of Tabriz, Tabriz, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • رفرنس های متنی مثل خروجی کراس رف را در اینجا ...
  • Adonina, I.G., E.A. Salina, E.G. Pestsova and M.S. Röder. 2005. ...
  • Ahn, S., J.A. Anderson, M.E. Sorrells and S.D. Tanksley. 1993. ...
  • Andrew, H., J.E. Paterson, M.D. Bawers, X.D. Buraw, G.E. Christin ...
  • Beales, J., A. Turner, S. Griffiths, J.W. Snape and D.A. ...
  • Bennetzen, J.L. and M. Freeling. 1997. The unified grass genome: ...
  • Botstein, D., R.L. White, M. Skolnick and R.W. Davis. 1980. ...
  • Castillo, A., G. Dorado, C. Feuillet, P. Sourdille and P. ...
  • Castillo, A., H. Budak, A. C. Martin, G. Dorado, A. ...
  • Castillo, A., H. Budak, R.K. Varshney, G. Dorado, A. Graner ...
  • Colmer, T. D., T. J. Flowers and R. Munns. 2006. ...
  • Fahima, T., M.S. Roder, A. Grama and E. Nevo. 1998. ...
  • Feldman, M. and A.A. Levy. 2005. Allopolyploidy- a shaping force ...
  • Feuillet, C. and G.J. Muehlbauer. 2009. Genetics and Genomics of ...
  • Gororo, N.N., H.A. Hagles, R.F. Eastwood, M.E. Nicolas and R.G. ...
  • Holton, T.A., J.T. Christopher, L. McClure, N. Harker and R.J. ...
  • Hovhannisyan, N.A., M.E. Dulloo, A.H. Yesayan, H. Knupffer and A. ...
  • Huang, S.X., A. Sirikhachornkit, X.J. Su, J. Faris, B. Gill, ...
  • Hulbert, S.H., T.E. Richter, J.D. Axtell and J.L. Bennetzen. 1990. ...
  • Korzun, V., M.S. Roder, K. Wedehake, A. Pasqualone, C. Lotti, ...
  • Kuleung, C., P.S. Baenziger and I. Dweikat. 2004. Transferability of ...
  • Kurata, N., G. Moore, Y. Nagamura, T. Foote, M. Yano, ...
  • Li, J.Z., T.G. Sjakste, M.S. Roder and M.W. Ganal. 2003. ...
  • Lina, M.A., Y.M. Mohammad and H. Nadia. 2012. The genetic ...
  • Liu. K. and S.V. Muse. 2005. Power Marker: Integrated analysis ...
  • Maestra, B. and T. Naranjo. 2000. Genome evolution in Triticeae. ...
  • Magurran, A.E. 2004. Measuring Biological Diversity. Blackwell. ...
  • Mason-Gamer, R.J. 2005. The ß-amylase genes of grasses and a ...
  • Miki, Y., K. Yoshida, N. Mizuno, S. Nasuda, K. Sato ...
  • Nei, M. 1973. Analysis of gene diversity in subdivided populations. ...
  • Nei, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance ...
  • Oliveira, E.J., J.G. Paìdua, M.I. Zucch, R. Vencovsky and M.L.C. ...
  • Peakall, R. and P. Smouse. 2012. GenAlEx 6.5: Genetic analysis ...
  • Pestsova, E., V. Korzun, N.P. Goncharov, K. Hammer, M.W. Ganal ...
  • Petersen, G. and O. Seberg. 2005. Phylogenetic analysis of allopolyploid ...
  • Ramsay, L., M. Macaulay, D. S. Ivanissevich, K. MacLean, L. ...
  • Röder, M.S., J. Plaschke, S.U. Konig, A. Borner, M.E. Sorrells, ...
  • Rodriguez-Suarez, C., M.C. Ramirez, A. Martin and S.G. Atienza. 2011. ...
  • Safari, Z. and A.A. Mehrabi. 2019. Molecular phylogeny of Aegilops ...
  • Saghai Maroof, M.A., R.M. Biyashev, G.P. Yang, Q. Zhangf and ...
  • Schneider, A., I. Molnár and M. Molnár-Láng. 2008. Utilisation of ...
  • Sharma, S., H.S. Balyan, P.L. Kulwal, N. Kumar, R.K. Varshney, ...
  • Sourdille, P., M. Tavaud, G. Charmet and M. Bernard. 2001. ...
  • Tamura, K., D. Peterson, N. Peterson, G. Stecher, M. Nei ...
  • Tilman, D., C. Balzer, J. Hill and B. L. Belfort. ...
  • Varshney, R.K., R. Sigmund, A. Börner, V. Korzun, N. Stein, ...
  • Yildirim, A., N. Kandemir, O. Ates Sonmezoglu and T. Eserkaya ...
  • Zhang, L. 2006. Study of the transferability of microsatellite markers ...
  • رفرنس های متنی مثل خروجی کراس رف را در اینجا ...
  • Adonina, I.G., E.A. Salina, E.G. Pestsova and M.S. Röder. 2005. ...
  • Ahn, S., J.A. Anderson, M.E. Sorrells and S.D. Tanksley. 1993. ...
  • Andrew, H., J.E. Paterson, M.D. Bawers, X.D. Buraw, G.E. Christin ...
  • Beales, J., A. Turner, S. Griffiths, J.W. Snape and D.A. ...
  • Bennetzen, J.L. and M. Freeling. 1997. The unified grass genome: ...
  • Botstein, D., R.L. White, M. Skolnick and R.W. Davis. 1980. ...
  • Castillo, A., G. Dorado, C. Feuillet, P. Sourdille and P. ...
  • Castillo, A., H. Budak, A. C. Martin, G. Dorado, A. ...
  • Castillo, A., H. Budak, R.K. Varshney, G. Dorado, A. Graner ...
  • Colmer, T. D., T. J. Flowers and R. Munns. 2006. ...
  • Fahima, T., M.S. Roder, A. Grama and E. Nevo. 1998. ...
  • Feldman, M. and A.A. Levy. 2005. Allopolyploidy- a shaping force ...
  • Feuillet, C. and G.J. Muehlbauer. 2009. Genetics and Genomics of ...
  • Gororo, N.N., H.A. Hagles, R.F. Eastwood, M.E. Nicolas and R.G. ...
  • Holton, T.A., J.T. Christopher, L. McClure, N. Harker and R.J. ...
  • Hovhannisyan, N.A., M.E. Dulloo, A.H. Yesayan, H. Knupffer and A. ...
  • Huang, S.X., A. Sirikhachornkit, X.J. Su, J. Faris, B. Gill, ...
  • Hulbert, S.H., T.E. Richter, J.D. Axtell and J.L. Bennetzen. 1990. ...
  • Korzun, V., M.S. Roder, K. Wedehake, A. Pasqualone, C. Lotti, ...
  • Kuleung, C., P.S. Baenziger and I. Dweikat. 2004. Transferability of ...
  • Kurata, N., G. Moore, Y. Nagamura, T. Foote, M. Yano, ...
  • Li, J.Z., T.G. Sjakste, M.S. Roder and M.W. Ganal. 2003. ...
  • Lina, M.A., Y.M. Mohammad and H. Nadia. 2012. The genetic ...
  • Liu. K. and S.V. Muse. 2005. Power Marker: Integrated analysis ...
  • Maestra, B. and T. Naranjo. 2000. Genome evolution in Triticeae. ...
  • Magurran, A.E. 2004. Measuring Biological Diversity. Blackwell. ...
  • Mason-Gamer, R.J. 2005. The ß-amylase genes of grasses and a ...
  • Miki, Y., K. Yoshida, N. Mizuno, S. Nasuda, K. Sato ...
  • Nei, M. 1973. Analysis of gene diversity in subdivided populations. ...
  • Nei, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance ...
  • Oliveira, E.J., J.G. Paìdua, M.I. Zucch, R. Vencovsky and M.L.C. ...
  • Peakall, R. and P. Smouse. 2012. GenAlEx 6.5: Genetic analysis ...
  • Pestsova, E., V. Korzun, N.P. Goncharov, K. Hammer, M.W. Ganal ...
  • Petersen, G. and O. Seberg. 2005. Phylogenetic analysis of allopolyploid ...
  • Ramsay, L., M. Macaulay, D. S. Ivanissevich, K. MacLean, L. ...
  • Röder, M.S., J. Plaschke, S.U. Konig, A. Borner, M.E. Sorrells, ...
  • Rodriguez-Suarez, C., M.C. Ramirez, A. Martin and S.G. Atienza. 2011. ...
  • Safari, Z. and A.A. Mehrabi. 2019. Molecular phylogeny of Aegilops ...
  • Saghai Maroof, M.A., R.M. Biyashev, G.P. Yang, Q. Zhangf and ...
  • Schneider, A., I. Molnár and M. Molnár-Láng. 2008. Utilisation of ...
  • Sharma, S., H.S. Balyan, P.L. Kulwal, N. Kumar, R.K. Varshney, ...
  • Sourdille, P., M. Tavaud, G. Charmet and M. Bernard. 2001. ...
  • Tamura, K., D. Peterson, N. Peterson, G. Stecher, M. Nei ...
  • Tilman, D., C. Balzer, J. Hill and B. L. Belfort. ...
  • Varshney, R.K., R. Sigmund, A. Börner, V. Korzun, N. Stein, ...
  • Yildirim, A., N. Kandemir, O. Ates Sonmezoglu and T. Eserkaya ...
  • Zhang, L. 2006. Study of the transferability of microsatellite markers ...
  • نمایش کامل مراجع