ژنهای اختصاصی مسیر تولید هورمون براسینواستروئید شناسایی شده بر مبنای تحلیل ترانسکریپتوم گیاه دارویی هندوانه ابوجهل (Citrullus colocynthis L.)

براسینواستروئیدها )BRS( گروهی از هورمون های استروئیدی گیاهی هستند که رشد و توسعه آن را تنظیم می کنند. مطالعه ی حاضر به منظور شناسایی شبکه های ترانسکریپتوم ژنی مرتبط با مسیر بیوسنتزی هورمون براسینواستروئید در بافت میوه هندوانه ابوجهل اجرا شد. این داده ها یک ترانسکریپت مرجع برای پایگاه داده ژنومی هندوانه ابوجهل برای مطالعات آینده ایجاد میکنند. تکنیک توالی یابی RNA، بنسازه Iluumina HiSeq2500 به صورت خوانشهای دو طرفه 2×150 روی گیاه هندوانه ابوجهل اجراگردید. در مرحله ی کنترل کیفیت با استفاده از نرم افزارهای FastQC و Trimmomatic تعداد 885،952،21 خوانش دارای کیفیت بالا تولید شد. مرحله ی یکپارچه سازی نوپدید با استفاده از برنامه ی Evidential-gene تعداد 311،55 تکژن را حاصل کرد. از توالی تک ژنهای یکپارچه شده علیه پایگاه KAAS تعداد 657،13 تکژن تفسیرشده که این تعداد در 134 مسیر زیستی قرار گرفتند. با بررسی تک ژن های مرتبط با مسیر بیوسنتزی هورمون براسینواستروئید، 32 شناسه ژنی (K) در 8 مسیر شناسایی شد.

کلیدواژه ها:

براسینواستروئید ، توالی یابی نسل جدید ، هندوانه ابوجهل ، یکپارچه سازی نوپدید