ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

تعیین توالی ژنوم کامل و فیلوژنی جدایه های نژاد شدید ویروس پیچیدگی زرد برگ گوجه فرنگی جدا شده از تاتوره Datura stramomum L. در منطقه بجنورد، ایران

محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 6، شماره: 1
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 231

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1127725

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-6-1_005

تاریخ نمایه سازی: 15 آذر 1399

چکیده مقاله:

ویروس پیچیدگی زرد برگ گوجه فرنگی , TYLCV) Tomato yellow leaf curl virus) به همراه ده گونه ویروسی و نژادهایشان که به ویروس­های شبه TYLCV معروفند عامل خسارت به گوجه فرنگی (Solanum lycopersicum L.) در مناطق گرمسیر، نیمه گرمسیر و معتدل دنیا می باشند. در این بررسی تعداد سه جدایه TYLCV-IL از گیاهان تاتوره در منطقه بجنورد همسانه سازی و ژنوم کامل آنها تعیین توالی گردید.  توالی اسید نوکلئیک ژنوم کامل آنها به همراه تعداد نه جدایه TYLCV-IL  گزارش شده ازایران و هشت  توالی سایر ویروس­های Begomovirus گوجه فرنگی از ایران  و سایر مناطق دنیا  مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج فیلوژنی جدایه­ها نشان داد که تکامل جمعیت نژاد TYLCV-IL در ایران وابسته به جغرافیا بوده و صرفنظر از گونه میزبان واریانت­های شمال شرق و جنوب ایران به طور مجزا در دو زیرگروه جداگانه قرار گرفتند. جدایه TYLCV-IL[IR:Sh40:07], GUO76444 از منطقه شیراز با هیچکدام از جمعیت­های شمال شرق و جنوب ایران گروه بندی نشد. این جدایه با نژاد تیپ TYLCV-IL گزارش شده از فلسطین اشغالی قرابت نزدیکی داشته و با یکدیگر در یک زیر گروه مجزا قرار گرفتند. نتایج تجزیه فیلوژنی نشان داد که این جدایه از نظر تکاملی به عنوان پل ژنتیکی بین جدایه­های TYLCV-IL حوزه مدیترانه­ای و ایران محسوب می­شود. این اولین گزارش از گیاه تاتوره به عنوان میزبان  نژاد TYLCV-IL  در ایران و همچنین حضور این نژاد ویروسی در منطقه بجنورد و استان خراسان شمالی  می­باشد

کلیدواژه ها:

TYLCV-IL ، خراسان شمالی ، بگوموویروس

نویسندگان

محمدرضا حسین زاده
مسعود شمس بخش
کاظم پور اوصالو

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Azizi A, Shams-Bakhsh M, Mozafari J, Montazeri-Hedesh R (2012). Complete ...
  • Bananej K, Kheyr-Pour A, Salekdeh GH, Ahoonmanesh A (2004). Complete ...
  • Bananej K, Vahdat A, Hosseini-Salekdeh G (2009). Begomoviruses associated with ...
  • Behjatnia SAA, Dry IB, Rezaian MA ( 2001). Sequence divergence ...
  • Briddon RW, Bull SE, Mansoor S, Amin I, Markham PG ...
  • Brown JK, Idris AM, Torres-Jerez I, Banks G K, Wyatt ...
  • Brown JK, Fauquet CM, Briddon RW, Zerbini M, Moriones E, ...
  • Cullings KW (1992). Design and testing of a plant -specific ...
  • Czosnek H, Laterrot H (1997). A worldwide survey of tomato ...
  • Diaz-Pendon JA, Canizares MC, Moriones E, Bejarano ER, Czosnek H, ...
  • Doyle JJ, Doyle JL (1987). A rapid DNA isolation procedure ...
  • Duffy S, Holmes EC (2007). Multiple introductions of the Old ...
  • Duffy S, Holmes EC (2008). Phylogenetic evidence for rapid rates ...
  • Fazeli R, Heydarnejad J, Massumi H, Shaabanian M, Varsani A ...
  • Hajimorad MR, Kheyr-pour A, Alavi V, Ahoonmanesh A, Bahar M, ...
  • Idris AM, Guerrero JC, Brown JK (2007). Two distinct isolates ...
  • Inoue-Nagata AK, Albuquerque LC, Rocha WB, Nagata T (2004). A ...
  • Jupin I, De Kouchkovsky F, Jouanneau F, Gronenborn B (1994). ...
  • Kheyr-Pour A, Bendahmane M, Matzeit V, Accotto G P, Crespi ...
  • Lapidot M (2002). Screening common bean (Phaseolus vulgaris) for resistance ...
  • Lefeuvre P, Martin DP, Harkins G, Lemey P, Gray AJ, ...
  • Mansoor S, Amin I, Iram S, Hussain M, Zafar Y, ...
  • Moriones E, Navas-Castillo J (2000). Tomato yellow leaf curl virus, ...
  • Mubin M, Shahid MS, Tahir MN, Briddon RW, Mansoor S ...
  • Navot N, Pichersky E, Zeidan M, Zamir D, Czosnek H ...
  • Pakniat A, Behjatnia SAA., Kharazmi S, Shahbazi M, Izadpanah K ...
  • Polston J, McGovern R, Brown L (1999). Introduction of tomato ...
  • Rojas MR, Gilbertson RL, Russell DR, Maxwell DP (1993). Use ...
  • Sambrook JR, Russel DW (2001). Molecular cloning: a laboratory manual. ...
  • Silva SJC, Castillo‐Urquiza GP, Hora‐Júnior BT, Assunção IP, Lima GSA, ...
  • Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, ...
  • Varma A, Malathi VG (2003). Emerging geminivirus problems: a serious ...
  • Wartig L, Kheyr-Pour A, Noris E, De Kouchkovsky F, Jouanneau ...
  • Webster CG, Coutts BA, Jones RAC, Jones MGK, Wylie SJ ...
    • نمایش کامل مراجع