ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

ارزیابی تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت ارقام برنج با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره مرتبط با تجمع آهن و روی

محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 6، شماره: 4
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 204

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1127681

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-6-4_001

تاریخ نمایه سازی: 15 آذر 1399

چکیده مقاله:

تعیین میزان تنوع ژنتیکی موجود در ذخایر ژنتیکی برنج، اولین گام در جهت پیشرفت برنامه‏های به‏نژادی برنج می‏باشد. در این مطالعه تنوع ژنتیکی 50 رقم برنج با استفاده از 40 نشانگر ریزماهواره مرتبط با آهن و روی مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج تجزیه مولکولی نشان داد که تعداد آلل‏های مشاهده شده در هر جایگاه نشانگری با میانگین 27/5 آلل از 2 تا 10 آلل متغیر بود. میزان محتوای اطلاعات چندشکلی در بین نشانگرها از 24/0 (RM19675) تا 83/0(RM276, RM402)  متغیر بود. میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی 63/0 برآورد شد. بیشترین میزان تنوع ژنتیکی و شاخص شانون در نشانگر RM276 مشاهده گردید. در ارزیابی تجزیه ساختار، ارقام به دو زیر جمعیت تقسیم شدند، زیر جمعیت اول شامل ارقام بومی و دوم شامل ارقام اصلاحی و خارجی بودند. در تجزیه واریانس مولکولی، واریانس درون جمعیتی بیشتر از واریانس بین جمعیتی بوده و حداقل فاصله ژنتیکی بین ارقام اصلاحی و خارجی و حداکثر آن بین ارقام بومی و خارجی مشاهده شد. براساس تجزیه خوشه‏ای نیز ارقام بومی در گروه مجزایی نسبت به سایر ارقام قرار گرفتند. این نتایج می‏تواند جهت طراحی برنامه‏های به‏نژادی آهن و روی دانه و گسترش پایه‏های ژنتیکی ارقام برنج استفاده شود

کلیدواژه ها:

تجزیه خوشه‏ای ، تجزیه ساختار جمعیت ، شاخص شانون ، محتوای اطلاعات چندشکلی

نویسندگان

شهربانو ابوطالبی
محمد حسین فتوکیان
مهرشاد زین العابدینی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Botstein D, White RL, Skolnick M, Davis RW (1980). Construction ...
  • Cole CR, Grant FK, Swaby-Ellis ED, Smith JL, Jacques A, ...
  • Evanno G, Regnaut S, Goudet J (2005). Detecting the number ...
  • Excoffier L, Laval G, Schneider S (2005). Arlequin (version 3.0): ...
  • Garcia‐Oliveira AL, Tan L, Fu Y, Sun C (2009). Genetic ...
  • Ghandilyan A, Vreugdenhil D, Aarts GM (2006). Progress in the ...
  • Huson DH (1998). SplitsTree: analyzing and visualizing evolutionary data. Bioinformatics. ...
  • Huson DH, Bryant D (2006). Application of Phylogenetic Networks in ...
  • Karp A, Edwards KJ, Bruford M, Funk S, Vosman B, ...
  • Liu K, Muse SV (2005). PowerMarker: an integrated analysis environment ...
  • Lu K, Li L, Zheng X, Zhang Z, Mou T, ...
  • Mburu D, Hanotte O (2005). A practical approach to microsatellite ...
  • Mohammadi SA, Parsanna BM (2003). Analysis of genetic diversity in ...
  • Moumeni A, Emanykhah F, Maleki Zanjani B, Maleki S (2007). ...
  • Nei M (1978). Estimation of average heterozygosity and genetic distance ...
  • Noori Z, Honarnejad R, Moameni A, Ebadi AA, Allahgholipoor M ...
  • Norton GJ, Deacon CM, Xiong L, Huang S, Meharg AA, ...
  • Omidbakhsh Fard MA (2005). Study of genetic diversity in durum ...
  • Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P (2000). Inference of population ...
  • Rabbani MA, Masood MS, Shinwari ZK, Yamaguchi-Shinozaki K (2010). Genetic ...
  • Safaie N, Alizadeh A, Saidi A, Rahimian H, Adam G ...
  • Shannon CE, Weaver W (1949). The mathematical theory of communication. ...
  • Stangoulis AJ (2010). Technical aspects of zinc and iron analysis ...
  • Stangoulis JC, Huynh BL, Welch RM, Choi EY, Graham RD ...
  • Susanto U (2008). Mapping Of Quantytative Trait Loci For High ...
  • Tabkhkar N, Rabiei B, Sabouri A (2011). Allelic frequency and ...
  • Yashitola J, Thirumurugan T, Sundaram R, Naseerullah M, Ramesha M, ...
  • Zane L, Bargelloni L, Patarnello T (2002). Strategies for microsatellite ...
    • نمایش کامل مراجع