ارزیابی پلی مورفیسم ژن ‭S1 ‬ویروس برونشیت عفونی پرندگان در جدایه های بومی و واکسینال با استفاده از روش تعیین توالی نوکلیوتیدی

ویروس برونشیت عفونی در پرندگان جوان موجب عفونت دستگاه تنفسی، کاهش وزن گیری وعدم استفاده بهینه از دان مصرفی می شود. این ویروس می تواند از عوامل مستعد کننده و آغازگر دیگر عفونت های ویروسی و باکتریایی که سبب بیماری های تنفسی و سیستمیک می شوند به شمار رود. طبیعت قابل انتقال ویروس و ظهور سروتیپ های متعدد موجب گردیده است که کنترل این بیماری را علیرغم استفاده از واکسن ها امری پیچیده نماید. هدف از این مطالعه بررسی تعیین هویت ملکولی ژن S1 ویروس برونشیت عفونی پرندگان در نمونه های جدا شده از گله هایی با علایم سندرم تنفسی طی زمستان ‮‭88‬ و بهار ‮‭89‬ در ایران بود. در این مطلعه شجره شناسی و توالی اسیدهای نوکلییک و اسید آمینه های متناظر قطعه ای از ژن S1 در چهار جدایه این مطالعه، ‭Razi-HKM‬‮‭891‬ ‭Razi-HKM‬،‮‭894‬ ‭Razi-HKM‬،‮‭893‬ ‭Razi-HKM‬‮‭892‬ و ‮‭19‬ جدایه استاندارد و وحشی ویروس برونشیت عفونی پرندگان از کشورهای مختلف، به عنوان نماینده سویه های آن کشور ها و 6 جدایه ایران که قبلا در بانک ژن ثبت گردیده اند به عنوان نماینده جدایه های ایران و ده نوع واکسن رایج مورد مصرف در ایران و سایر کشورهای جهان بررسی و مورد مقایسه قرار گرفتند. جدایه ‭Razi-HKM‬‮‭891‬ و ‭Razi-HKM‬‮‭894‬ همخوان با سویه پاتوژن ‮‭793‬‭/B ‬بودند. اسیدهای آمینه جدایه ‭Razi-HKM‬‮‭892‬ با جدایه ‭Razi-HKM‬‮‭893‬ حدود ‮‭17/3‬ درصد با یکدیگر و با دو جدایه ‭Razi-HK‬‮‭891‬ و ‮‭7/22‬ ‭Razi-HKM‬‮‭894‬ درصد اختلاف نشان دادند. این جدایه ها ‮‭23/1‬درصد با سویه پاتوژن ‮‭793‬‭/B ‬و با سویه ماساچوست ‭(M‬‮‭41‬) به ترتیب دارای ‮‭23/1‬ و ‮‭27/1‬ درصد اختلاف داشتند. جدایه های ‭Razi-HKM‬‮‭892‬ و ‭Razi-HKM‬‮‭893‬ با جدایه هایی که قبلا در ایران شناخته و در بانک ژنی ثبت شده اند نیز متفاوت می باشند. جدایه ‭Razi-HKM‬‮‭893‬ برای اولین بار در ایران گزارش می شود و با جدایه های کشورهای فلسطین اشغالی و عراق دارای همخوانی بسیار زیادی است.