استفاده از مدل بیزی برای افزایش صحت اعتبارسنجی ژنومی در جوامع ژنتیکی دوردست مرجع و هدف

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 405

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ISCAG03_006

تاریخ نمایه سازی: 2 شهریور 1399

چکیده مقاله:

پیش بینی ژنومی در اصلاح گاوهای شیری به دلیل کاهش فاصله نسل و انتخاب حیوان در ابتدای زندگی نسبت به روش سنتی انتخاب، پیشرفت چشمگیری داشته است. مطالعات زیادی گزارش نموده اند که یکی از فاکتورهای تاثیرگزار روی صحت پیش بینی ژنومی، خویشاوندی بین جمعیت مرجع و هدف است. با افزایش فاصله ژنتیک بین جمعیت مرجع و هدف، صحت پیش بینی ژنومی کاهش پیدا می کند. هدف از مطالعه حاضر بررسی صحت پیش بینی ژنومی در جوامع دوردست ژنتیکی به کمک داده شبیه سازی برای مدل بیزی و GBLUP بود. سه سناریو برای ارتباط خویشاوندی بین جمعیت مرجع و هدف ایجاد شد. رابطه خویشاوندی بین دو جمعیت در سه سناریو به ترتیب بیشتر از 0/4، بین 0/2 تا 0/4 و کمتر از 0/2 طراحی شد. نتایج پژوهش حاضر نشان داد که میزان افزایش صحت پیش بینی ژنومی در سه سناریو برای روش بیزین B نسبت به GBLUP به ترتیب 0/04، 0/06 و 0/12 برآورد شد. هر چه میزان خویشاوندی بین دو جمعیت مرجع و هدف کمتر بود، میزان تفاوت بین صحت پیش بینی ژنومی در روش بیزین B نسبت به GBLUP بیشتر برآورد گردید و این افزایش نیز معنی دار برآورد شد. در تمام سناریوها برای روش بیز B نسبت به روش GBLUP ضریب رگرسیون پیش بینی ژنومی نزدیک به عدد 1 بدست آمد که صحت بیشتر این روش را می رساند. بطور کلی نتایح پژوهش حاضر نشان دادکه روش بیز B نسبت به روش GBLUP برای زمانی که رابطه خویشاوندی بین جمعیت مرجع و هدف کم باشد با صحت بیشتر و اریب کمتر صحت پیش بینی ژنومی را برآورد می کند.

نویسندگان

یحیی محمدی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

جواد احمدپناه

بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان کرمانشاه، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرمانشاه، ایران