پروفایل ترانسکریپتوم یاخته های گرانولوزای تخمدان گاو در مراحل مختلف فولیکولوژنسیز

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 497

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-48-3_015

تاریخ نمایه سازی: 6 خرداد 1399

چکیده مقاله:

آخرین مرحله فولیکولوژنسیز در فولیکول تخمدان پستانداران شامل بیشترین توسعه و اوج فعالیت لایه­های بافت پوششی (اپیتلیال) یاخته­های گرانولوزا است که حفره آنترال را احاطه کرده­اند. در طول رشد و توسعه فولیکول، یاخته­های گرانولوزا تکثیر می­شوند و هورمون­های لازم برای رشد اووسیت را ترشح می­کنند. در گاو، فولیکول نیاز به رشد تا قطر بالای 10 میلی متر دارد تا آماده برای تخمک­ریزی شود و پس از این مرحله یاخته­های گرانولوزا تغییر کرده و تبدیل به توده یاخته­های ویژه­ای بنام جسم زرد می­شوند. برای درک بهتر اساس مولکولی رشد فولیکولی و بلوغ یاخته­های گرانولوزا، پروفایل ترانسکریپتوم یاخته­های گرانولوزا از کوچک (<5mm) تا بزرگ (> 10mm) با استفاده از روش داده­کاوی بررسی شد. درمجموع با مقایسه ترانسکریپتوم یاخته­های گرانولوزای بزرگ و کوچک درمجموع 283 ژن شناسایی شدند. با بازسازی شبکه و تجزیه آن موفق به شناسایی آثار متقابل آن­ها و درنهایت با استفاده از ابزارهای مختلف درزمینه پیدا کردن ماژول­های مهم و عملکردی، شش ماژول شناسایی شد که مهم ترین ژن­های مرتبط شامل αTNF، NR1H4، LHCGR، FSHR،  PTHLH، LHB، CAD، HSD3B1، CYP17A1، DICE1، MCE1، COX و آروماتاز بودند. این مشاهده ها توصیه می­کند که شش ماژول شناسایی شده در بررسی می توانند به عنوان نشانگرهایی برای مرحله نهایی تمایز فولیکول و آغاز مرگ یاخته باشند.

نویسندگان

ابوالفضل بهرامی

دانشجوی دکتری، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

سید رضا میرائی آشتیانی

استاد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

مصطفی صادقی

دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

علی نجفی

استادیار، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله الاعظم، تهران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Amsterdam, A., Gold, R. S., Hosokawa, K., Yoshida, Y., Sasson, ...
  • Andrews S. (2010). FastQC: a quality control tool for high throughput ...
  • Assenov, Y., Ram, F., Schelhorn, S.E., Lengauer, T. &amp; Albrecht, ...
  • Austin, E. J., Mihm, M., Evans, A. C. O., Knight, ...
  • Bader, G. D. &amp; Hogue, C. W. (2003). An automated ...
  • Baerwald, A. R., Adams, G. P. &amp; Pierson, R. A. ...
  • Basini, G., Mainardi, G. L., Bussolati, S. &amp; Tamanini, C. ...
  • Blankenberg, D., Gordon, A., Von Kuster, G., Coraor, N., Taylor, ...
  • Bolger, A. M., Lohse, M. &amp; Usadel, B. (2014). Trimmomatic: ...
  • Du, P., Kibbe, W. A. &amp; Lin, S. M. (2008). ...
  • Ginther, O. J., Kastelic, J. P. &amp; Knopf, L. (1989). ...
  • Ginther, O. J., Beg, M. A., Donadeu, F. X. &amp; ...
  • Goodman, A. L. &amp; Hodgen, G. D. (1983). The ovarian ...
  • Hatzirodos, N., Hummitzsch, K., Irving-Rodgers, H. F., Harland, M. L. ...
  • Huang, D. W., Sherman, B. T. &amp; Lempicki, R. A. ...
  • Ireland, J. J., Mihm, M., Austin, E., Diskin, M. G. ...
  • Ireland, J. J. &amp; Richards, J. S. (1978). Acute effects ...
  • Johnson, A. L. (2003). Intracellular mechanisms regulating cell survival in ...
  • Johnson, A. L. &amp; Bridgham, J. T. (2002). Caspase-mediated apoptosis ...
  • Kim, D., Pertea, G., Trapnell, C., Pimentel, H., Kelley, R. ...
  • Mihm, M. &amp; Bleach, E. C. (2003). Endocrine regulation of ...
  • Mihm, M., Austin, E. J., Good, T. E., Ireland, J. ...
  • Montojo, J., Zuberi, K. &amp; Rodriguez, H. (2014). GeneMANIA: Fast ...
  • Mukae, N., Enari, M., Sakahira, H., Fukuda, Y., Inazawa, J., ...
  • Nepusz, T., Yu, H. &amp; Paccanaro, A. (2012). Detecting overlapping ...
  • Paul, D., Thomas, M. J., Campbell, A., Kejariwal, H. M., ...
  • Pru, J. K. &amp; Tilly, J. L. (2001). Programmed cell ...
  • Rao, J. U., Shah, K. B., Puttaiah, J. &amp; Rudraiah, ...
  • Rice, V. M., Williams, V. R., Limback, S. D. &amp; ...
  • Richards, J. S. (2001). Perspective: the ovarian follicle-a perspective in ...
  • Richards, J. S., Ireland, J. J., Rao, M. C., Bernath, ...
  • Ritchie, M. E., Phipson, B., Wu, D., Hu, Y., Law, ...
  • Rivera, G. M. &amp; Fortune, J. E. (2003). Proteolysis of ...
  • Sasson, R., Winder, N., Kees, S. &amp; Amsterdam, A. (2002). ...
  • Shannon, P., Markiel, A., Ozier, O., Baliga, N. S., Wang, ...
  • Spicer, L. J. &amp; Alpizar, E. (1994). Effects of cytokines ...
  • Tilly, J. L. (2001). Commuting the death sentence: how oocytes ...
  • Terranova, P. F. (1997). Potential roles of tumor necrosis factor-a ...
  • Trapnell, C., Williams, B. A., Pertea, G., Mortazavi, A., Kwan, ...
  • Walsh, S. W., Mehta, J. P, McGettigan, P. A. &amp; ...
  • نمایش کامل مراجع