مطالعات بیولوژیکی ، ساختاری و عملکرد CRISPR–Cas9

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 586

فایل این مقاله در 29 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ICSDA04_0998

تاریخ نمایه سازی: 4 دی 1398

چکیده مقاله:

بسیاری از سیستم های متصل به کریسپر (Cas)- تناوب های کوتاه پالیندروم فاصله دار منظم خوشه ای (CRISPR)از اندونوکلئاز RNA-DNA و راهنمای دوگانه برای دفاع در برابر فاژ های مهاجم و پلازمیدهای کانجیوگیت بوده که با معرفی قطعه های اختصاصی دو رشته ای موجود در DNA هدف کاربرد دارند. تشخیص هدف به شدتنیازمند حضور یک موتیف کوتاه پروتینی (PAM) در قسمت جانبی مکان هدف بوده که با تشکیل حلقه R وبرش رشته، از طریق جفت شدگی باز مکمل بین RNA راهنما و DNA هدف، برهمکنش های Cas9–DNA وتغییرات کنفورماسیونی مرتبط صورت می گیرد. استفاده از CRISPR–Cas9 به عنوان برنامه ویرایش و هدف یابیDNA قابل رونویسی توسط RNA از طریق یک آران ای راهنما تک رشته ای یا آر ان ای زیر ژنومی (sgRNA)تسهیل می شود که دارای ساختار مشابه با ساختار دوگانه ی طبیعی CRISPR RNA - CRISPR RNA(tracrRNA) فعال کننده ی ترانس می باشد. هدف از این مقاله ی مروری، ارائه یک دانش ساختاری و مکانیسمی عمیق از هدف یابی و برش DNA با RNA راهنما و به واسطه Cas9 (کس 9) می باشد. اطلاعات مولکولی مربوط به مطالعات ساختاری و بیوشیمیایی، چارچوبی را برای مهندسی منطقی با هدف تغییر نقش وکارکرد کاتالیزوری، اختصاصی بودن آر ان ای راهنما و نیاز به موتیف های PAM و کاهش فعالیت اثرات خارج ازهدف (off-target) برای توسعه ی کاربردهای مبتنی بر Cas9 در برابر بیماری های ژنتیکی را فراهم می کند.

کلیدواژه ها:

، Cas9 ، CRISPR ، مهندسی ژنوم ، ساختار ، مکانیزم ، اثرات خارج از هدف

نویسندگان

مهرداد صالح زاده

کارشناس ارشد بیماری شناسی گیاهی

احمد اشرفی بلوک آباد

کارشناس ارشد بیماری شناسی گیاهی