آنالیز تبارزایی توالی دو ژن پروتئین حرکتی و پوششی جدایه ویروس موزاییک توتون از استان گلستان

ویروس موزاییک توتون (Tobacco mosaic virus ) متعلق به جنس Tobamovirus از خانواده Virgaviridae بوده و دارای ژنومی یک بخشی از نوع آر.ان. ای تک لای مثبت است. این ویروس یکی از مهمترین عوامل بیماریزای گیاهی در سراسر جهان است که دامنه میزبانی آن وسیع بوده و بیش از 200 گونه گیاهی را آلوده مینماید. در سال 1397، تعدادی نمونه برگی توتون با علائم موزائیک و تاولی از منطقه علی آباد کتول در استان گلستان جمع آوری و آر.ان.ای کل آنها استخراج شد. ناحیه ژن پروتئین حرکتی و بخشی از ژن پروتئین پوششی جدایه ها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروس مذکور تکثیر گردید. قطعه تکثیرشده 951) جفت باز) مربوط به یک جدایه در حامل پلاسمیدی pTG19-T وارد و در سویه DH5 باکتری Escherichia coli همسانه سازی شد و سپس از دو جهت توالی یابی گردید (شماره دسترسی .(MK966711 در آنالیز تبارزایی این جدایه در مقایسه با سایر جدایه های این ویروس در دنیا (در مجموع 85 جدایه)، همه جدایه های TMV به دو گروه کاملا مجزا (G1, G2) تقسیم شدند که 83 جدایه در گروه G1 قرار گرفتند. گروه G1 به دو زیرگروه اصلی تقسیم شده و جدایه ایرانی از استان گلستان به صورت مستقل در زیرگروه شماره G1B قرار گرفت. در آنالیز یکنواختی نوکلئوتیدی، جدایه گلستان بیشترین میزان یکسانی (identity) نوکلئوتیدی را به ترتیب با دو جدایه چینی 93/4) EU796225 درصد) و 92/9) MH595920 درصد) از توتون نشان داد. بیشترین میزان یکسانی این جدایه در سطح اسیدآمینه ای نیز با جدایه های مذکور تعیین گردید. این اولین گزارش از بررسی مولکولی ویروس موزاییک توتون در استان گلستان است.