تعیین ترادف قطعه کوچک و ژن غیر ساختمانی قطعه M جدایه تره ویروس لکه زرد زنبق ( Iris yellow spot (virus

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 337

نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

PPC01_189

تاریخ نمایه سازی: 23 مهر 1398

چکیده مقاله:

ویروس لکه زرد زنبق (Iris yellow spot virus) از مخربترین ویروسها در گیاهان زراعی و زینتی محسوب میشود که مخصوصا در محصولهپیاز اهمیت زیادی دارد. ژنوم این ویروس از سه قطعه ار. ان. ای. تک لای خطی تشکیل شده است که قطعات کوچک (S) و متوسط (M) دوقطبی هستند و قطعه بزرگ (L) دارای قطبیت منفی است. ویروس در محصول پیاز و تره سبب بروز علائم لکه های کلروتیک و نکروتیک در سرتاسر برگها میشود و از طریق تریپس تنباکو (Thrips tabaci) منتقل میشود. تاکنون توالی قطعه S دو جدایه هلندی و هندی این ویروس گزارش شده است. در مطالعه حاضر توالی کامل قطعه S و ژن NSm جدایه تره این ویروس گزارش میشود. جدایه تره ویروس روی گیاه Nicotiana bentamiana مایهزنی شد و بعد از سه بار پاساژ با استفاده از میزبان تک لکه Vigna angiuculata، به منظور نگهداری طولانی مدت روی گیاه فلفل زینتی Capsicum annuum مستقر شد. به منظور تعیین توالی قطعه S و ژن NSm از آغازگرهای عمومی گروه یوراسیایی توسپوویروسها و همچنین آغازگرهای اختصاصی طراحی شده برای تکثیر سایر مناطق قطعه S و ژن NSm در آزمون RT-PCR استفاده شد. توالیهای حفاظت شده در دو انتهای قطعه S، برای طراحی آغازگرها برای دو انتها استفاده شد. نتایج تعیین توالی قطعه S جدایه ایرانی نشان داد که شامل دو ORF با چیدمان آمبیسنس مشابه سایر اعضای جنس Orthotospovirus است. ژن نوکلئوکپسید (N) جدایه مذکور به طول 822 نوکلئوتید، بیشترین شباهت (98/1 - 97/9) را به ترتیب ازنظر توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی با سایر جدایه های استان مرکزی نشان داد. بیشترین شباهت ژن غیر ساختمانی قطعه S (NSs ) به طول 1332 و ژن غیر ساختمانی قطعه (NSm) M به طول 936 نوکلئوتید، ازنظر توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی به ترتیب به میزان (95/8-97) و (96/7 - 98/7) با جدایه هلندی ویروس مذکور مشاهده شد. مقایسه منطقه IGR جدایه ایرانی با دو جدایه دیگر موجود در بانک ژن نشان داد که جدایه ایرانی به ترتیب 55 و 54 نوکلئوتید از جدایه های هلندی و هندی ویروس مذکور طویلتر است. چنین تغییراتی میتواند ناشی از خطای آنزیم همانندسازی یا نوترکیبی غیر همولوگ باشد.

نویسندگان

حسین بیات

پژوهشکده گل و گیاه زینتی (محلات)، موسسه علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی

مسعود شمس بخش

گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس

افشین حسنی مهربان

واخنینگن- هلند