اعتبار سنجی دو SNP وابسته به مقاومت به Fusarium oxysporum در کولتیوارهای تجاری چغندرقند

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 302

نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

PPC01_169

تاریخ نمایه سازی: 23 مهر 1398

چکیده مقاله:

گونه های Fusarium spp. باعث ایجاد خسارت شدید در تعداد زیادی از محصولات کشاورزی، بهویژه چغندرقند میشوند. گونه Fusarium oxysporum به لحاظ تاریخی به عنوان زیانبارترین گونه نسبت به همه گونه ها موردتوجه واقع شده است. گیاه چغندرقند جهت اطمینان از عملکرد مطلوب شکر باید از این رده از تیمارگرهای خاکزاد محافظت شود. کنترل ژنتیکی بیماری در مدیریت بیمارگرهای قارچی بسیار مهم است. شناسایی و اعتبارسنجی نشانگرهای پلی مورفیسم تک نوکلئوتید (SNP) مرتبط با مقاومت میتواند یک ابزار قدرتمند برای معرفی ژنهای ارزشمند موردنیاز برای تولید گونه های مقاوم به Fusarium باشد. اهداف از این تحقیق عبارت بودند از: (1 اعتبارسنجی جهش های SNP مرتبط با مقاومت به Fusarium در ارقام چغندرقند زراعی؛ (2 شناسایی ارقام مقاوم چغندرقندهای تجاری با استفاده از این دو .SNP پرآزارترین جدایه بیماریزای F. oxysporum برای مایهزنی ارقام مورداستفاده قرار گرفت. سطح زیر منحنی پیشرفت بیماری (AUDPC)برای هر رقم محاسبه شد. شاخص برداشت (HI) با استفاده از فرمول Ruppelمحاسبه شد. پلت فرم بیواسپرینت (Qiagen, Germany) 96 و (Thermo, USA) QuantStudio 12K-flex برای جداسازیDNA و ژنووتایپینگ SNP به ترتیب استفاده شدند. گیاهان با استفاده از دو مخلوط واکنش (IDT, USA) rhAmp ژنوتایپ شدند که در این تحقیق دو مخلوط به عنوان SNP1 و SNP2 نام گذاری شدند. نرم افزار SAS (موسسه SAS، آمریکا) برای تجزیه تحلیل آماری استفاده شد. از دو مارکر موردبررسی SNP1 با شدت همبستگی بالایی با مقاومت ارقام تجاری مرتبط بود. مدل رگرسیون SNP1 به طور معنیداری تغییرات در نتایج AUDPC را پیشبینی کرد. این مطالعه گامی اولیه برای بهبود مقاومت به چغندرقند در برابر F. oxysporum در آینده است. بنابراین، نتیجه گیری شد که دوSNP انتخابشده میتوانند در برنامه های اصلاح مقاومت به Fusarium در چغندرقند استفاده شوند.

نویسندگان

سمیه مشاری

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان

سیدباقر محمودی

موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه بذر چغندرقند، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

رقیه همتی

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان

پیرجورجیو استواناتو

گروه کشاورزی، غذا، منابع طبیعی و محیط، دانشگاه پادوا، ایتالیا