ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

مطالعه ایمونوبیوانفورماتیک پروتئین اتوترانزپورتر پادگن 43 اشریشیاکلی انتروتوکسیژنیک جدا شده از گوساله

محل انتشار: فصلنامه تحقیقات دامپزشکی، دوره: 74، شماره: 1
سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 489

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/932654

شناسه ملی سند علمی:

JR_JVR-74-1_014

تاریخ نمایه سازی: 6 مهر 1398

چکیده مقاله:

زمینه مطالعه: تلاش ها در زمینه تهیه واکسن های کارآمد برای مقابله با ایکولای انتروتوکسیژنیک (ETEC) به سمت شناسایی پادگن های حراست شده ژنومی معطوف شده است. پادگن 43 یکی از اعضای خانواده بزرگ پروتئین های ترشحی باکتری ایکولای و سایر باکتری های گرم منفی با نام اتوترانزپورترها (ATs) است. پروتئین های اتوترانزپورتر ساختمان حراست شده مشابهی دارند و تعدادی از آن ها به دنبال عفونت های طبیعی و تجربی ETEC شناسایی شده اند. پادگن 43 با داشتن خصوصیات حدت زای تجمع سلولی و تشکیل بیوفیلم و حضور در سرم انسان های مبتلا به اسهال ناشی از ETEC، هدف ارزشمندی در تهیه واکسن محسوب می شود. هدف: در این مطالعه با بهره گیری از روش های تجربی و ایمونوانفورماتیک به بررسی دقیق ساختار آنتی ژنی و ارزیابی ایمنی زایی پروتئین پادگن 43 سویه 510 ایکولای ETEC جدا شده از گوساله ها پرداختیم. روش کار: توالی اسیدآمینه ای، خصوصیات فیزیکی- شیمیایی، پایداری، ساختار دوم و سوم پروتئین و  توانایی بالقوه در ایجاد پاسخ های ایمنی سلول های B و T با دارا بودن اپی توپ های موثر و خصوصیات آلرژی زا بودن آن از جمله شاخص های مورد توجه در این پژوهش هستند. نتایج: در این مطالعه 15 قطعه پپتیدی محرک پاسخ یاخته های B و T شناسایی شده است که تعداد 9 عدد از آن ها به عنوان پادگن معرفی گردیدند. نتیجه گیری نهایی: نتایج حاصل از مطالعات مجازی (in-silico) انجام شده روی این پروتئین حاکی از مناسب بودن آن برای تهیه واکسن های کلی باسیلوز گاو  است.  

کلیدواژه ها:

نویسندگان

ریحانه قربانپور

دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران

غلامرضا نیکبخت بروجنی

۱گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران

سید امیر حسین جلالی

۲دانشکده منابع طبیعی دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران ۳پژوهشکده زیست فناوری و مهندسی زیستی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abbass, J., Nebel, J. C., Mansour, N. (2013). Ab initio ...
  • Ansari, H. R., Raghava, G. P. (2010). Identification of conformational ...
  • Bhasin, M., Garg, A., Raghava, G. (2005). PSLpred: prediction of ...
  • Bhasin, M., Raghava, G. (2005). Pcleavage: an SVM based method ...
  • Biasini, M., Bienert, S., Waterhouse, A., Arnold, K., Studer, G., ...
  • Buchan, D. W., Minneci, F., Nugent, T. C., Bryson, K., ...
  • Cheng, J., Randall, A. Z., Sweredoski, M. J., Baldi, P. ...
  • Chou, P. Y., Fasman, G. D. (1974). Prediction of protein ...
  • De Luna, M. d. G., Scott-Tucker, A., Desvaux, M., Ferguson, ...
  • Diaz, A. A., Tomba, E., Lennarson, R., Richard, R., Bagajewicz, ...
  • Doytchinova, I. A., Flower, D. R. (2007). VaxiJen: a server ...
  • Drozdetskiy, A., Cole, C., Procter, J., Barton, G. J. (2015). ...
  • EL-Manzalawy, Y., Dobbs, D., Honavar, V. (2008). Predicting linear B-cell ...
  • Emini, E. A., Hughes, J. V., Perlow, D., Boger, J. ...
  • Gasteiger, E., Hoogland, C., Gattiker, A., Wilkins, M.R., Appel, R.D., ...
  • Harris, J. A., Roy, K., Woo-Rasberry, V., Hamilton, D. J., ...
  • Heffernan, R., Paliwal, K., Lyons, J., Dehzangi, A., Sharma, A., ...
  • Henderson, I. R., Navarro-Garcia, F., Desvaux, M., Fernandez, R. C., ...
  • Heras, B., Totsika, M., Peters, K. M., Paxman, J. J., ...
  • Huang, T.-T., Hwang, J.-K., Chen, C.-H., Chu, C.-S., Lee, C.-W., ...
  • Kaur, H., Raghava, G. (2004). A neural network method for ...
  • Kaur, H., Raghava, G. (2004). Prediction of α-turns in proteins ...
  • Kelley, L. A., Mezulis, S., Yates, C. M., Wass, M. ...
  • Kim, D. E., Chivian, D., Baker, D. (2004). Protein structure ...
  • Kloczkowski, A., Ting, K. L., Jernigan, R., Garnier, J. (2002). ...
  • Larsen, J. E. P., Lund, O., Nielsen, M. (2006). Improved ...
  • Laskowski, R. A., MacArthur, M. W., Moss, D. S.,Thornton, J. ...
  • Lovell, S. C., Davis, I. W., Arendall, W. B., de ...
  • Ma, J., Wang, S., Zhao, F., Xu, J. (2013). Protein ...
  • Nielsen, M., Lundegaard, C., Lund, O., Keşmir, C. (2005). The ...
  • Nielsen, M., Lundegaard, C., Lund, O., Petersen, T.N. (2010). CPHmodels-3.0—remote ...
  • Nikbakht Brujeni, G., Ghorbanpour, R., Esmailnejad, A. (2016). Association of ...
  • Patronov, A., Doytchinova, I. (2013). T-cell epitope vaccine design by ...
  • Pieper, U., Webb, B. M., Dong, G. Q., Schneidman-Duhovny, D., ...
  • Reche, P. A., Reinherz, E. L. (2007). Prediction of peptide-MHC ...
  • Rechsteiner, M., Rogers, S. W. (1996). PEST sequences and regulation ...
  • Saha, S., Raghava, G. (2004). BcePred: prediction of continuous B-cell ...
  • Saha, S., Raghava, G. (2006). AlgPred: prediction of allergenic proteins ...
  • Saha, S., Raghava, G. (2006). Prediction of continuous B-cell epitopes ...
  • Shivu, B., Seshadri, S., Li, J., Oberg, K. A., Uversky, ...
  • Söding, J., Biegert, A., Lupas, A. N. (2005). The HHpred ...
  • Soni, B., Seniya, C., Misra, R.,Vyas, V. (2013). Immuno-informatic approach ...
  • Tomar, N., De, R. K. (2010). Immunoinformatics: an integrated scenario. ...
  • Vander Woude, M. W., Henderson, I. R. (2008). Regulation and ...
  • Wang, P., Sidney, J., Kim, Y., Sette, A., Lund, O., ...
  • Wells, T. J., Tree, J. J., Ulett, G. C., Schembri, ...
  • Wiederstein, M., Sippl, M. J. (2007). ProSA-web: interactive web service ...
  • Xu, D., Zhang, Y. (2011). Improving the physical realism and ...
  • Yachdav, G., Kloppmann, E., Kajan, L., Hecht, M., Goldberg, T., ...
  • Yang, J., Yan, R., Roy, A., Xu, D., Poisson, J., ...
  • Yu, C. S., Lin, C. J., Hwang, J. K. (2004). ...
  • Zhang, G. L., Srinivasan, K. N., Veeramani, A., August, J. ...
    • نمایش کامل مراجع