کاربرد بارکدگذاری DNA در شناخت گیاهان دارویی با استفاده از بارکد

بارکدگذاری DNA ابزار بیوانفورماتیکی و مولکولی است که متمم آرایه بندی، فیلوژنی مولکولی و ژنتیک جمعیت است. در اینروش از توالی کوتاه rbcL به عنوان بارکد استاندارد گیاه برای شناسایی گونه ها در مقیاس بزرگ استفاده می شود. در این پژوهش به- منظور بارکدگذاری گیاهان بارهنگ، بابونه، بومادران، ثعلب از منطقه ژنی کلروپلاستی rbcL استفاده گردید. بعد از استخراج DNA، محصولات PCR خالص شده تعیین توالی گردید و تحت آنالیز بیوانفورماتیکی قرارگرفتند. گیاه بومادران و ثعلب در مقایسه با گونه های همجنس ثبت شده در سایت NCBI به راحتی تفکیک شدند. همچنین، SNP گیاهان بابونه، بومادران و ثعلب با گونه های گیاهی موجود در سایت NCBI به ترتیب 4، 59 و 56 برآورد شد. میزان شباهت توالی نوکلئوتیدی rbcL گونه های موردمطالعه با گونه های همجنس برای گیاه بابونه 95 ، بومادران 78/4 تا 89/7 و ثعلب 69/1 تا 83/6 درصد محاسبه گردید. همچنین، بابونه (Chamomilla Matricaria) با M.Chamomilla بومی انگلستان، بومادران (Achillea millefolium) با A.Ptarmica بومی انگلستان، ثعلب (.Orchis spp) با O.Mascula بومی انگلستان بیشترین درصد شباهت را نشان داد.

کلیدواژه ها:

گیاهان دارویی ، بارکدگذاری DNA ، منطقه ژنی کلروپلاستی rbcL