Taxonomy process for RNA motif discovery
محل انتشار: هشتمین همایش بیوانفورماتیک ایران
سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 558
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
IBIS08_074
تاریخ نمایه سازی: 9 مرداد 1398
چکیده مقاله:
A motif is a small part of DNA or RNA sequence which has the constant size and related to the DNA and RNA functions [1]. Recently discovered non-coding RNAs especially microRNAs with regulatory functions has opened a new research area [2-5]. Finding the motif pattern and function provide an attractive research path for bioinformaticists [6]. Many algorithms have been devised to solve the RNA motif discovery problem, nevertheless, due to the lack of a standard benchmark, quantitative work needed to evaluate their performance. Accordingly, the aim of the current study were to present a taxonomy for the motif discovery process in RNA. This taxonomy provides a systematic way to the RNA motif discovery problem which includes 4 dimensions: 1) approaches and algorithms that have been used to identify and predict motifs in RNA molecule; 2) information which is used as inputs of algorithms and tools; 3) active agents involved in the motif discovery in RNA; and 4) the application of RNA motifs in different fields. Studying each dimensions helps to get a better insight of the motif discovery process in RNA and presents a complete and comprehensive category which enhances the speed of access to motif discovery algorithms and tools.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
علی مقصودی
۱بیوانفورماتیک، فناوری نوین، دانشگاه زابل. زابل، ایران
زهرا میر
۲بیوانفورماتیک،دانشکده فناوری نوین، دانشگاه زابل،زابل،ایران
محمد اله بخش
۳بیوانفورماتیک،فناوری نوین، زابل، زابل، ایران