تعیین تنوع ژنتیکی باکتریها در شکمبه بز با استفاده از توالی یابی 16S rRNA
محل انتشار: نشریه میکروبیولوژی دامپزشکی، دوره: 13، شماره: 1
سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 323
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JVM-13-1_001
تاریخ نمایه سازی: 18 تیر 1398
چکیده مقاله:
تنوع ژنتیکی جمعیت باکتریایی در شکمبه بز با استفاده از یک روش مولکولی و مستقل از کشت مورد بررسی قرار گرفت. به دلیل شرایط منحصر بهفرد تغذیهای و زندگی، این انتظار وجود دارد که بزها دارای جمعیت باکتریایی متفاوتی نسبت به سایر نشخوارکنندگان باشند. در نتیجه درک صحیح این جمعیت میکروبی در نژادهای مختلف بز و بررسی تغییرات آنها در پاسخ به رژیمهای مختلف تغذیهای و بررسی تنوع آنها در زیستگاههای مختلف بسیار ضروری است. از این رو فرآیند PCR و تعیین توالی کتابخانه کلون ژن 16S rRNA با استفاده از یک نمونه مخلوط حاصل از کل محتویات شکمبه مربوط به 12 بز بومی شمال ایران با استفاده از پرایمرهای عمومی برای باکتریها انجام پذیرفت. بزها از گلههای پرواری تغذیه شده با خوراک مخلوط کنسانتره و علوفه انتخاب شدند. مجموعا 15 توالی 16S rRNA مورد آنالیز قرار گرفت. از این 15 توالی 4 توالی دارای شباهت با Streptococcus bovis بودند و 3 توالی با Selenomonas ruminantium همخوانی داشتند. همچنین 2 توالی شبیه به Megasphera elsdenii بودند و 2 توالی دیگر با Prevotella ruminicola شباهت داشتند. 2 کلون نیز با باکتریهای کشت نیافته شکمبه گاو شباهت داشتند. از این 15 توالی یک توالی به Lactobacillus plantarum شبیه بود و یک توالی باقیمانده نیز دارای شباهت با Prevotella multiformis بود.این تحقیق برای اولین بار تنوع مولکولی جمعیت باکتریها را در شکمبه بزها در ایران مورد مطالعه قرار داد. بررسی نتایج این تحقیق نشان داد که این حیوانات دارای جمعیت باکتریایی مشابه با سایر نشخوارکنندگان در سایر نقاط دنیا میباشند. هر چند که ما توالیهایی را نیز جداسازی نمودیم که با میکروارگانیسمهای شناخته شده در دستگاه گوارش در یک خوشه قرار نمیگرفتند که این مساله میتواند به علت اختلافات فردی در حیوانات میزبان در حین نمونه گیری، نوع جیره، روشهای استخراج DNA یا پرایمرهای مورد استفاده برای PCR بوده باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سید مهدی اصحابی
دانش آموخته دکتری تخصصی گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران
محمد چمنی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران
کاوه جعفری خورشیدی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد قائمشهر
مهدی امین افشار
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :