ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
ورود |عضویت رایگان |راهنمای سایت |عضویت کتابخانه ها
عنوان
مقاله

مطالعه عدم تعادل پیوستگی و شناسایی ساختار بلوک های هاپلوتیپی در گاوهای سرابی

سال انتشار: 1397
کد COI مقاله: JR_JAP-20-1_003
زبان مقاله: فارسیمشاهده این مقاله: 127
فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای 13 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله مطالعه عدم تعادل پیوستگی و شناسایی ساختار بلوک های هاپلوتیپی در گاوهای سرابی

حمید مرزبانی - دانشجویی کارشناسی ارشد. گروه علوم دامی، ،دانشگاه تهران
حسین مرادی شهربابک - پردیس کشاورزی و منابع طبعیی، دانشگاه تهران، تخصص: ژنتیک و اصلاح نژاد دام/ ژنتیک مولکولی/ بحث ژنومیک
محمد مرادی شهربابک - پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشکده علوم زراعی و دامی، تخصص: ژنتیک و اصلاح نژاد دام/ ژنتیک کمی/ تجزیه داده ها/ آمار/ ارزیابی ژنومیک

چکیده مقاله:

این مطالعه به منظور محاسبه الگوی عدم تعادل پیوستگی و تعیین ساختار بلوک های هاپلوتیپی برای 93 راس گاو نژاد سرابی با استفاده از اطلاعات نشانگرهای SNP حاصل از CHIP 40k SNP- شرکت ایلومینا انجام شد. بعد از تعیین ژنوتیپ و کنترل کیفیت داده های ژنومی، 27386 SNP روی کروموزوم های اتوزومی جهت آنالیز های بعدی مورد استفاده قرار گرفت. عدم تعادل پیوستگی با استفاده از دو آماره r2 و D اندازه گیری شد. در این مطالعه میانگین r2 و D برای جفت SNP ها در دامنه کمتر از 5/2 کیلو جفت باز به ترتیب با مقادیر 505/0 و 927/0 حداکثر و میانگین r2 و D برای جفت SNP ها در دامنه Mb5-2 به ترتیب با مقادیر 064/0، 486/0 حداقل بود. در ژنوم گاو سرابی 582 بلوک هاپلوتیپی مشاهده شد. درصد پوشش SNP ها در بلوک های هاپلوتیپی از کل SNP ها 73/6 درصد بود که 83/0 درصد (43/21 مگا جفت باز) از ژنوم اتوزومی توسط این بلوک های هاپلوتیپی پوشش داده شد. اندازه موثر جمعیت در طی چهار نسل قبل حدود40 راس برآورد شد. تعداد کم بلوک های هاپلوتیپی و همچنین LD پایین به دست آمده در جمعیت گاو سرابی نشان دهنده تنوع بالا در این جمعیت است. با توجه به نتایج و تعداد بلوک های هاپلوتیپی در این نژاد، در نظر گرفتن بلوک های هاپلوتیپی برای انتخاب ژنومی باعث بهبود نتایج و افزایش دقت می شود لذا توصیه می گردد در راستای مطالعات ژنومیکی به جای استفاده از تک نشانگرها از بلوک های هاپلوتیپی استفاده شود

کلیدواژه ها:

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

کد یکتای اختصاصی (COI) این مقاله در پایگاه سیویلیکا JR_JAP-20-1_003 میباشد و برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/886015/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
مرزبانی، حمید و مرادی شهربابک، حسین و مرادی شهربابک، محمد،1397،مطالعه عدم تعادل پیوستگی و شناسایی ساختار بلوک های هاپلوتیپی در گاوهای سرابی،https://civilica.com/doc/886015

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1397، مرزبانی، حمید؛ حسین مرادی شهربابک و محمد مرادی شهربابک)
برای بار دوم به بعد: (1397، مرزبانی؛ مرادی شهربابک و مرادی شهربابک)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

  • حسین زاده م(1386) معرفی نژادهای گاو شیری، گوشتی، دورگ و ...
  • فلاحی م ح (1395)مطالعه  و  شناسایی ساختار هاپلوتیپی گاومیش­های  نژاد ...
  • Ardlie K, Kruglyak L and Seielstad M (2002) Patterns of ...
  • Barbato M, Orozco-terWengel P, Tapio M and Bruford M (2015) ...
  • Barrett J, Fry B, Maller J and Daly M (2004) ...
  • Bohmanova J, Sargolzaei M and Schenkel F (2010) Characteristics of ...
  • Browning S and Browning B (2007) Rapid and accurate haplotype ...
  • Corbin L, Liu A, Bishop S and Woolliams J (2012) ...
  • Espigolan R, Baldi F , Boligon A , Souza F, ...
  • Farnir F, Coppieters W, Arranz J, Berzi P and Cambisano ...
  • Farré M, Micheletti D and Ruiz-Herrera A (2012) Recombination rates ...
  • Frankham R, Bradshaw C and Brook B (2014) Genetics in ...
  • Gabriel S, Schaffner S, Nguyen H, Moore J, Roy J, ...
  • Gautier M, Faraut T, Moazami-Goudarzi K, Navratil V, Foglio M, ...
  • Hill W and Robertson A (1968) Linkage disequilibrium in finite ...
  • Hayes B (2007) QTL mapping MAS and genomic selection A. ...
  • Khatkar M, Collins A, Cavanagh J, Hawken, R ,Hobbs M, ...
  • Khatkar M, Zenger K, Hobbs M, Hawken R, Cavanagh J, ...
  • Mokry F, Buzanskas M, de Alvarenga Mudadu M, do Amaral ...
  • Reich D and Lander E (2001) on the allelic spectrum ...
  • Sargolzaei M, Schenkel F, Jansen G and Schaeffer L (2008) ...
  • Sabeti P, Reich D, Higgins J, Levine H, Richter D, ...
  • Sved J (1971) Linkage disequilibrium and homozygosity of chromosome segments ...
  • Varilo T, Paunio T, Parker A, Perola M, Meyer J, ...
  • Zhao H, Nettleton D, Soller M and Dekkers J (2005) ...
  • مدیریت اطلاعات پژوهشی

    صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

    اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: دانشگاه دولتی
    تعداد مقالات: 68,023
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

    پشتیبانی