شبیه سازی دینامیک مولکولی یک DNA اریگامی مثلثی

در این پژوهش، DNA اریگامی مثلثی که دارای مشخصات ظاهری و عملکردی ویژهای می باشد، به عنوان یکنانووسیله دارای چند درجه آزادی معرفی شده و به کمک دینامیک مولکولی به تحلیل عملکرد آن پرداختهمی شود. اولین گام در شناخت یک نانووسیله تحلیل ساختاری آن میباشد. ما در این گزارش ابتدا DNA اریگامیمثلثی را در نرم افزار 1- Nano Engineer طراحی و سپس تغییرات ساختاری نانووسیله را در دمای 300˚C بااستفاده از نرم افزار GROMACS مورد بررسی قرار داده ایم. نتایج بدست آمده نشان میدهد، DNA اریگامیمثلثی را میتوان برای کاربردهای نانورباتیک مورد استفاده قرار داد. در واقع پارامتری که در این نانووسیله بسیارجالب توجه است، انعطاف پذیری بالای بازوهای آن است.

کلیدواژه ها:

دینامیک مولکولی ، انعطاف پذیری ، DNA اریگامی ، نانووسیله ، نرم افزار GROMACS ، نرم افزار Nano Engineer-1