ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
ورود |عضویت رایگان |راهنمای سایت |عضویت کتابخانه ها
عنوان
مقاله

کاربرد الگوریتم uMelt SM در آنالیز منحنی ذوب Real-time PCR

سال انتشار: 1397
کد COI مقاله: JR_JOAGK-10-2_003
زبان مقاله: فارسیمشاهده این مقاله: 214
فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای 16 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله کاربرد الگوریتم uMelt SM در آنالیز منحنی ذوب Real-time PCR

اناهیتا خارابی ماسوله - دانش آموخته کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه علوم گیاهی و بیوتکنولوژی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران.
عباس سعیدی - هیئت علمی موسسه ملی گیاهان زینتی (NIOP)، تحقیقات باغبانی علوم، تحقیقات کشاورزی، آموزش و توسعه، محلات، ایران.

چکیده مقاله:

یکی از چالش­های موجود در تفسیر نتایج qPCR ، اطمینان از اختصاصی بودن قطعات تکثیر شده است که برای بررسی آن از آنالیز منحنی ذوب استفاده می­شود. پیک­های اضافی در منحنی ذوب همیشه نشان دهنده یک مشکل نیست، به همین منظور در این مقاله یک ابزار مبتنی بر وب به نام uMelt SM به عنوان راهکاری کاربردی و ساده برای آنالیز صحیح منحنی ذوب به محققین پیشنهاد می­گردد که امکان پیش­بینی منحنی ذوب DNA و پروفیل­های واسرشته سازی را با وضوح بالای فلورسنت از محصولات PCR فراهم می­کند. نتایج این مطالعه نشان داد که منحنی­های ذوب براساس چه پارامترهایی تولید شده و الگوریتم مناسب برای نحوه کار با این نرم افزار ارائه گردید. در نهایت ژن­های اکتین و سوپراکسید دیسموتاز از قارچ  Pyricularia oryzae به عنوان الگوی مناسب برای تعیین منحنی پیش­بینی شده با استفاده از این نرم­افزار ارائه گردید و منحنی Real-time PCR نیز ترسیم شد. براساس نتایج منحنی ذوب با استفاده از نرم افزار uMelt SM در مقایسه با منحنی ذوب دستگاه Real-Time PCR تطابق بالایی را نشان می­دهد که این نتایج تاییدی بر مزیت­هایی همچون سهولت استفاده، صرفه­جویی در زمان، هزینه و تلاش در بخش تجربی با استفاده از این نرم­افزار می­باشد.

کلیدواژه ها:

qPCR, منحنی ذوب, آزمایش, پیش بینی, uMelt SM

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

کد یکتای اختصاصی (COI) این مقاله در پایگاه سیویلیکا JR_JOAGK-10-2_003 میباشد و برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/864826/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
خارابی ماسوله، اناهیتا و سعیدی، عباس،1397،کاربرد الگوریتم uMelt SM در آنالیز منحنی ذوب Real-time PCR،https://civilica.com/doc/864826

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1397، خارابی ماسوله، اناهیتا؛ عباس سعیدی)
برای بار دوم به بعد: (1397، خارابی ماسوله؛ سعیدی)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

  • Blake RD, Delcourt SG (1998). Thermal stability of DNA. Nucleic ...
  • Blake RD, Bizzaro JW, Blake JD, Day GR, Delcourt SG, ...
  • Blossey R, Carlon E (2003). Reparametrizing the loop entropy weights: ...
  • Capote N, Pastrana AM, Aguado A, Sánchez-Torres P (2012). Molecular ...
  • Crothers DM (1968). Calculation of melting curves for DNA. Biopolymers ...
  • Downey N (2014). Interpreting melt curves: An indicator, not a ...
  • Dwight Z, uMelt Technical Guide v2.0, University of Utah, Wittwer ...
  • Dwight Z, Palais R, Wittwer CT (2011). uMELT: prediction of ...
  • Gotoh O (1983). Prediction of melting profiles and local helix ...
  • Markham NR, Zuker M (2005). DINAMelt web server for nucleic ...
  • Mehdizadeh, V., Nassaghusseini, S M., Safaei, N., Saidi, A., NCBI: ...
  • Primrose SB, Twyman RM (2001). Old RW Principles of Gene ...
  • Ririe KM, Rasmussen RP, Wittwer, CT (1997). Product differentiation by ...
  • SantaLucia J (1998). A unified view of polymer, dumbbell, and ...
  • Steger G (1994). Thermal denaturation of double-stranded nucleic acids: prediction ...
  • Tøstesen E, Liu F, Jenssen TK, Hovig, E (2003). Speed-up ...
  • University of Utah, Department of pathology, Why Use uMELT , ...
  • von Ahsen N, Wittwer CT, Schutz E (2001). Oligonucleotide melting ...
  • Zimm BH (1960). Theory of Melting of the helical form ...
  • مدیریت اطلاعات پژوهشی

    صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

    اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: دانشگاه دولتی
    تعداد مقالات: 19,278
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

    پشتیبانی