کنکاش بیوانفورماتیکی ریزRNA های bta-mir-146a ، bta-mir- 223،bta-mir 21-5p ، bta-mir-181 و bta-mir-16a در مسیرهای پیام دهی سلولی ورم پستان درگاو شیری

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 417

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-11-1_001

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

چکیده مقاله:

هدف: کنکاش مسیرهای پیام دهی در بیماری هایی مثل ورم پستان در گاو شیری که بیشتر تحت تاثیر فرایندهای فراژنتیک هستند، ضروری به نظر می رسد. مواد و روش­ها: در این پژوهش 5 مولکول ریزRNA کاندید با شماره دسترسی های bta-mir- 223،bta-mir 21-5p ، bta-mir-181، bta-mir-146a و bta-mir-16a در منابع شناسایی و استخراج شدند و با استفاده از پایگاه داده Mirtarbase و پایگاه داده Targetscan به ترتیب ژن های هدف تایید شده و پیش بینی شده برای هر یک از ریزRNAهای بالا استخراج شدند. سپس بیان ژن های هدف پیش بینی شده و تایید شده برای هر یک از ریزRNAهای بالا در بافت غدد پستانی در پایگاه NCBI بررسی شدند. علاوه بر این با استفاده از نرم افزار DAVID، مسیرهای پیام رسانی سلولی در KEGG مشخص شدند. نتایج: بر اساس نتایج بدست آمده مشخص شد که ریز  bta-mir-146a RNAاز طریق تاثیر بر 7 پروتئین، و ریز RNA bta-mir-223 از طریق تاثیر بر 11 پروتئین و ریز bta-mir 21-5p RNA از طریق تاثیر بر 9 پروتئین در مسیرهای پیام دهی سلولی مختلفی درگیر هستند، و لذا احتمالا در بیماری ورم پستان گاو شیری نقش دارند. همچنین نتایج نشان داد که دو ریز  bta-mir-181 RNAو bta-mir-16a در مسیرهای پیام دهی مهمی مثل GnRH signaling pathway، Estrogen signaling pathway، Progesterone-mediated oocyte maturation، Oxytocin Signaling Pathway و MAPK Signaling Pathway  نقش مهمی را بازی می کنند. نتیجه گیری: این پژوهش نشان می دهد که ریزRNAهای مورد بررسی می توانند به عنوان نشانگرهای مولکولی، در علت یابی ملکولی بیماری ورم پستان گاو شیری نقش مهمی ایفا کنند.

کلیدواژه ها:

بیوانفورماتیک ، ریز RNA ، مسیر پیام رسانی سلولی ، ورم پستان ، KEGG

نویسندگان

مصطفی قادری

یاسوج دانشگاه یاسوج دانشکده کشاورزی

زهرا بیرانوند

دانشگاه گیلان

سید حسین حسینی مقدم

دانشگاه گیلان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • خراتی­کوپایی حامد، محمدآبادی محمدرضا و همکاران (1390) تغییرات ژنتیکی ژن ...
  • خراتی­کوپایی حامد، محمدآبادی محمدرضا، ترنگ علی­رضا و همکاران (1391) بررسی ...
  • هادی­زاده مرتضی، محمدآبادی محمدرضا، نیازی علی و همکاران (1392) استفاده ...
  • هادی­زاده مرتضی، نیازی علی، محمدآبادی محمدرضا و همکاران (1392) تجزیه ...
  • Baghizadeh A, Bahaaddini M, Mohamadabadi MR, Askari N (2009) Allelic ...
  • Buitenhuis B, Røntved CM, Edwards SM et al. (2011) In ...
  • De Schepper S, De Ketelaere A, Bannerman DD et al. ...
  • Den Breems NY, Nguyen LK, Kulasiri D (2014) Integrated signaling ...
  • Duman RS, Voleti B (2012) Signaling pathways underlying the pathophysiology ...
  • Hadizadeh M, Mohammadabadi MR, Niazi A et al. (2013). Use ...
  • Hadizadeh M, Niazi A, Mohammad Abadi MR et al. (2014). ...
  • Hein G, Panzani C, Rodríguez F et al. (2015) Impaired ...
  • Huang DW, Sherman BT, Lempicki RA (2009) Systematic and integrative ...
  • Gigli I, Maizon DO (2013) MicroRNAs and the mammary gland: ...
  • Jin W, Ibeagha-Awemu EM, Liang G et al. (2014) Transcriptome ...
  • Kharrati Koopaei H, Mohammad Abadi MR, Ansari Mahyari S et ...
  • Kharrati Koopaei H, Mohammadabadi MR, Ansari Mehyari S et al. ...
  • Kharrati koopaei H, Mohammadabadi MR, Tarang A et al. (2012b) ...
  • Lakhter AJ, Pratt RE, Moore RE et al. (2018) Beta ...
  • Lawless N, Reinhardt TA, Bryan K et al. (2014) MicroRNA ...
  • Li L, Huang J, Zhang X et al. (2012) One ...
  • Li R, Zhang CL, Liao XX et al. (2015) Transcriptome ...
  • Liu Y, Zhang J, Zhou YH et al. (2015) IL-6/STAT3 ...
  • Martin G S. (2003) Cell signaling and cancer. Cancer cell ...
  • Maurin T, Cazalla D, Yang JS et al. (2012) RNase ...
  • Mohammadabadi MR, Shaikhaev GO, Sulimova GE et al (2004) Detection ...
  • Mohammadabadi MR, Soflaei M, Mostafavi H, Honarmand M (2011) Using ...
  • Mohammadi A, Nassiry MR, Mosafer J et al. (2009) Distribution ...
  • Naeem A, Zhong K, Moisá S et al. (2012) Bioinformatics ...
  • Ruzina MN, Shtyfurko TA, Mohammadabadi MR et al. (2010) Polymorphism ...
  • Rosa RD, Capelli-Peixoto J, Mesquita RD et al. (2016) Exploring ...
  • Santosh B, Varshney A, Yadava PK (2015) Noncoding RNAs: biological ...
  • Sengar GS, Deb R, Singh U et al. (2018) Identification ...
  • Slezak-Prochazka I, Durmus S, Kroesen BJ, van den Berg, A ...
  • Wang XP, Luoreng ZM, Zan LS et al. (2017) Bovine ...
  • Wu J, Li L, Sun Y et al. (2015) Altered ...
  • Yang G, Yang X (2010) Smad4-mediated TGF-β signaling in tumorigenesis. ...
  • نمایش کامل مراجع