مدل سازی QSAR و داکینگ مولکولی به منظور پیش بینی فعالیت ضد سرطانی بازدارنده های PARP-1

تکنیک محاسباتی QSAR به منظور دستیابی هر چه سریعتر و آسان تر به پارامترهای اساسی برای طراحی و تولید داروهای موردنیاز برای درمان بیماری BRCA1 روشی مقرون به صرفه و قابل اعتماد به شمار می آید. در این مطالعه، مدلسازی QSAR برای پیش بینی فعالیت ضد سرطانی به صورت غلظت مهارکنندگی نیمه (IC50) برای 51 ترکیب از مشتقات 1- اچ بنزو دی ایمیدازول- 4-کربوکسامید به عنوان بازدارنده های آنزیم PARP-1 علیه بیماری BRCA1 با استفاده از روش های GA-MLR و LS-SVM انجام گرفت. نتایج آماری ارجحیت نسبی مدل SVM به روش MLR را نشان داد به این صورت که پارامترهای آماری آن که شامل R2CV=9/049 و R2LOO=9/059 و F=130/730 و RMSE=0/132 بود، نقطه تاییدی بر قابل قبول بودن مدل انتخابی برای پیش بینی فعالیت بازدارندگی با درصد اطمینان بالا است. همچنین، داکینگ مولکولی به منظور دستیابی به انرژی آزاد اتصال و یافتن بهترین حالت اتصال لیگاند و آنزیم PARP-1 انجام شد که نتایج حاصل مکمل روش QSAR بود.

کلیدواژه ها:

QSAR ، داکینگ مولکولی ، BRCA1 ، PARP-1