آنالیز بیوانفورماتیک اپیتوپ های Bcell و Tcell در پروتیین متصل شونده به کولین باکتری استرپتوکوکوس پنومونیا

پروتیین متصل شونده به کولین (CbpD) از پروتیین های سطح سلولی پنوموکوک است و هدف ما از این مطالعه بررسی این پروتیین بعنوان کاندید واکسن پروتیینی بر ضد پنوموکک می باشد. بنابراین با استفاده از ابزار بیوانفورماتیک اپیتوپ های Bcell کانفورماسیونی و خطی و اپیتوپ های Tcell در این پروتیین تعیین شد و از میان آنها اپیتوپ هایی که قادر به القای پاسخ ایمنی محافظتی بودند، مشخص شدند. همپوشانی اپیتوپ های حفاظتی در ناحیه شامل آمینو اسید 2 تا 304 از پروتیین بالغ فاقد سیگنال پپتید مشاهده شد و همولوگ این قطعه در سروتیپ های مهم بیماری زای پنوموکوک با حداقل 97.8 % همولوژی وجود داشته است. بنابراین قطعه مذکور کاندید مناسبی برای تولید واکسن با پوشش گسترده سروتیپی ضد پنوموکوک می باشد.

کلیدواژه ها:

پروتیین متصل شونده به کولین ، پنوموکک ، واکسن