شناسایی آلل های خودناسازگاری در زردآلو با استفاده از پی سی آر و روش توالی یابی

زردآلو Prunus armeniaca L از گونه های مهم و اقتصادی جنس پرونوسو از خانواده روزاسه می باشد. اکثر ارقام تجارتی زردآلو خود ناسازگار و برخی نیز دگر ناسازگار هستند. خود ناسازگاری در زردآلو از نوع گامتوفیتیک بوده و توسط یک مکان ژنی با چند شکل آللی کنترل می شود. شناسایی آلل های خود ناسازگاری در زردآلو برای احداث باغات جدید و یا انتخاب والدین در برنامه های به نژادی زردآلو حایز اهمیت است. در این مطالعه آلل های خود ناسازگاری در تعدادی از ارقام و ژنوتیپ های زردآلو به روش واکنش زنجیرهای پلیمراز PCR و با استفاده از آغازگرهای ویژه بر اساس توالی نواحی حفاظت شده مکان ژنی خود ناسازگاری در جنس پرونوس تکثیر شدند. پس از الکتروفورز محصول پی سی آر، انجام کلونینگ و توالی یابی قطعات مورد نظر، میزان تشابه توالی ها با استفاده از برنامه FASTA و مراجعه به پایگاه اطلاعاتی NCBI بررسی گردید و آلل های مربوط به ژن S-RNase در ژنوتیپ های مورد مطالعه تعیین شدند. به کمک توالی اسید نوکلییکی آلل های شناسایی شده، تعیین ژنوتیپ S در ارقام مورد مطالعه با اطمینان بیشتری امکان پذیر بوده و یک روش مکمل برای شناسایی آلل های خودناسازگاری با استفاده از دی ان ای ژنومی ارقام زردآلو فراهم می کند.

کلیدواژه ها:

خود ناسازگاری ، زردآلو ، S-Rnase