دیاگرام فاز برای وابستگی سرعت عبور DNA از ریز ساختارها به طول آنها و میدان الکتریکی

سال انتشار: 1387
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 961

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CMC09_215

تاریخ نمایه سازی: 6 دی 1387

چکیده مقاله:

حرکت مولکول های DNA از میان یک آرایه شش وجهی تحت میدان الکتریکی یکنواخت بوسیله کامپیوتر شبیه سازی شد. پارامترهای شبیه سازی بر اساس آزمایش های گزارش شده انتخاب شدند و سپس با تغییر پارامترها، شبیه سازی در محدوده وسیعی از طول مولکول های DNA و شدت میدان الکتریکی انجام گرفت و طی آن وابستگی تحرک مولکول های DNA در گذر از شبکه های مذکور به طول آنها، و نیز یه شدت میدان الکتریکی به کار بسته شده، بررسی شد و نتیجه گرفته شد تحرک مولکول های DNA تابع نایکنواختی از طول آنها است و نیز این که مکان بیشینه ها وکمینه های تابع نا یکنواخت مذکور، به شدت میدان الکتریکی بکار برده شده وابسته است. این مشاهدات بر حسب فرایند فاکر- پلانگ و مدل سد آنتروپی تبیین شدند . با استفاده از معادلات لانژوین و معادلات فاکر- پلانگ مربوطه مدلسازی شدند. شبیه سازی با دو روش MVO واولر انجام شد. نتایج حاصل، پدیده را از طریق یک دیاگرام فاز که رابطه شدت میدان الکتریکی و طول مولکول DNA را بر قرار می سازد، توجیه می کند. مدل و دیاگرام فاز مربوطه در اینجا تبیینی برای نتایج متعارضی فراهم می آورد که نویسندگان قبلی درباره وابستگی تحرک مولکول DNA به طول آن در شبکه های نزدیک یا پایین شعاع ژیراسیون گزارش کرده اند.

نویسندگان

ناهید ملکی جیرسرایی

آزمایشگاه سیستمهای پیچیده، گروه فیزیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه ا

آروین فاطمی

دانشکده فیزیک، دانشگاه صنعتی شریف

محمدنبی سربلوکی

مرکز تحقیقات بیوفیزیک و بیوشیمی، دانشگاه تهران

شاهین روحانی

دانشکده فیزیک، دانشگاه صنعتی شریف