برآورد صحت ارزشهای اصلاحی در جوامع بدون شجره با استفاده از نشانگرهای متراکم (یک مطالعه شبیه سازی شده)

معمولا در بسیاری از گونه های در معرض انقراض و یا گونه های بومی شجره ای برای آنها وجود ندارد و یا ممکن استکه شجره از صحت لازم برخوردار نباشد. در چنین وضعیتی استفاده از داده های ژنوم می تواند مفید واقع شود و حیواناتبراساس محتوی ژنوم برای نسل های آینده انتخاب گردند. هدف از این مطالعه برآورد صحت ارزش های اصلاحی ژنومی درسناریوهای مختلف (شامل دو جمعیت موثر 100 و 1000 ، مقادیر وراثت پذیری پایین (0/05)، متوسط (0/30) و بالا (0/50))با استفاده از روش GBLUP و مقایسه آن با روش سنتی بود. در این تحقیق، ژنومی با 30 جفت کروموزوم به گونه ای شبیه-سازی شد که تعداد QTL ها حدود 1500 و تعداد نشانگرها (SNP) حدود 45000 جایگاه بودند. از معیار صحت، اریبی ومیانگین مربعات خطا برای مقایسه ی روش سنتی و GBLUP استفاده شد. نتایج نشان دادند که با جمعیت موثر 100 حیوان ودر وراثت پذیری پایین (0/05) روش GBLUP و سنتی دارای صحت مشابه بودند اما با افزایش جمعیت موثر به 1000 راسصحت ارزش های اصلاحی در روش ژنومی نسبت به سنتی کمی کاهش یافت. در هر دو نوع جمعیت موثر، با بالا رفتن مقداروراثت پذیری، صحت در هر دو روش افزایش یافت اما عملکرد روش GBLUP نسبت به روش سنتی بیشتر بود. روش سنتیBLUP دارای مقدار کمتری اریبی نسبت به روش GBLUP بود، اما در روش GBLUP با افزایش تعداد حیوان و وراثت-پذیری میزان صحت افزایش یافته و باعث شده که میانگین مربعات خطای کمتری نسبت به روش سنتی حاصل شود. بنابراینبرای جمعیت های بدون شجره استفاده از روش ژنومی GBLUP برای برآورد ارزش های اصلاحی و انتخاب حیوانات پیشنهاد می گردد.

کلیدواژه ها:

شبیه سازی ، صحت ، جمعیت موثر ، انتخاب ژنومی