ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

شناسایی لیدهای قوی جدید برای مهار سیکلواکسیژناز 2 با استفاده از تکنیک غربالگری مجازی با کارایی بالا در بانک اطلاعاتی UNPD

تعداد صفحات: 12 | تعداد نمایش خلاصه: 446 | نظرات: 0
سال انتشار: 1396
کد COI مقاله: BIOTECH01_153
زبان مقاله: فارسی
(فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد)
محتوای کامل این مقاله با فرمت WORD هم قابل دریافت می باشد.

راهنمای دانلود فایل کامل این مقاله

اگر در مجموعه سیویلیکا عضو نیستید، به راحتی می توانید از طریق فرم روبرو اصل این مقاله را خریداری نمایید.

برای عضویت در سیویلیکا به صفحه ثبت نام مراجعه نمایید.در صورتی که دارای نام کاربری در مجموعه سیویلیکا هستید، ابتدا از قسمت بالای صفحه با نام کاربری خود وارد شده و سپس به این صفحه مراجعه نمایید.

لطفا قبل از اقدام به خرید اینترنتی این مقاله، ابتدا تعداد صفحات مقاله را در بالای این صفحه کنترل نمایید.

برای راهنمایی کاملتر راهنمای سایت را مطالعه کنید.

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای 12 صفحه است به صورت فایل PDF و یا WORD در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:
فرمت فایل مورد نظر را انتخاب فرمایید:


مشخصات نویسندگان مقاله شناسایی لیدهای قوی جدید برای مهار سیکلواکسیژناز 2 با استفاده از تکنیک غربالگری مجازی با کارایی بالا در بانک اطلاعاتی UNPD

لیلی حیدرپور صارمی - گروه شیمی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه سیستان و بلوچستان، زاهدان، ایران
علی ابراهیمی - گروه شیمی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه سیستان و بلوچستان، زاهدان، ایران
میلاد لگزیان - گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه سیستان و بلوچستان، زاهدان، ایران

چکیده مقاله:

پروستاگلاندین ها واسطه های قوی التهابی هستند، توسط آنزیم سیکلواکسیژناز (COX) از اسید آرشیدونیک سنتز می شوند. COX در دو ایزوفرم نوع 1 و 2 (COX-1 و COX-2) دسته بندی می شود که هر دو هدف هایی برای درمان بوسیله داروهای مسکن غیراستروییدی غیرانتخابی (nsNSAID) هستند. با این حال COX-2 می تواند توسط برخی مهارکننده های انتخابی مهار شود. این ایزوفرم همچنین در التهاب، درد و تب دارای نقش پررنگتری در مقایسه با نوع دیگر است. جالب است که مهارکننده های انتخابی COX-2 برخی عوارض جانبی مانند زخم معده و خونریزی معده که مربوط به تجویز مهارکننده-هایCOX-1 هستند را از خود نشان نمی دهند. از این رو تمرکز بیشتری روی مهارکننده های COX-2 به عنوان آنزیم مهم درگیر در مسیر التهاب صورت گرفته است. هدف این تحقیق، شناسایی ترکیبات طبیعی موثر بر روی این آنزیم به عنوان کاندید قوی برای توسعه داروهای nsNSAID است. بدین منظور تکنیک غربالگری مجازی با کارایی بالا بر روی کتابخانه ترکیبات حاصل از بانک اطلاعاتی UNPD (229358 ترکیب ) با منشا طبیعی، استفاده شده است. ابتدا آماده سازی کتابخانه لیگاندها توسط نرم افزار BIOVIA Discovery Studio 2017 انجام شده است. در طی آماده سازی، برخی ویژگی های فیزیکی-شیمیایی ترکیبات شامل وضعیت والانس، بار، تاتومرها و شکل سه بعدی آن ها تصحیح یا تولید شده است. کتابخانه نهایی با فیلتر کردن کتابخانه اولیه بر اساس توصیفگرهای ADMET و قاعده 5 تایی لیپینسکی ایجاد شده است. این کتابخانه شامل بیش از 9300 لیگاند است. سپس رسپتور (5IKT) با حذف مولکول های آب، بهینه سازی ساختار و به حداقل رساندن انرژی با استفاده از نرم افزارSchrodinger2017-1 آماده شده است. به منظور انجام غربالگری مجازی، گرید داکینگ در اطراف جایگاه فعال آنزیم بوسیله ماژولGlide نرم افزار Schrodinger2017-1 تهیه شده است. محدودیت-های پیوند هیدروژنی بر روی رزیدوهای کلیدی داخل گرید بکار برده شده است. غربالگری مجازی در سه سطح دقت (HTVS> SP> XP) انجام شده است.10 درصد بالای لیگاندها که بالاترین امتیاز را در مرحله XP داشتند با استفاده از روش Rank by Rank با استفاده از نرم افزارهای مختلف ICM-PRO و MOE دوباره امتیازبندی شدند. طبقه بندی لیگاندها با توجه به میانگین امتیاز محاسبه شده آن ها با دو نرم افزار ذکر شده صورت گرفته است. سرانجام، سه لیگاند با امتیاز بالا به عنوان کاندیدهای قوی برای بررسی های بیشتر انتخاب شدند. ترکیبات به ترتیب دارای امتیاز اتصال داکینگ 24.394-، 22.743- و22.246- بودند. آن ها دارای برهمکنش های پیوند هیدروژنی با رزیدوهای کلیدی tyr385 و ser530 هستند. انرژی آزاد اتصال آن ها با اسید تولفنامیک به عنوان مهار کننده ی تجاری COX-2، نشان می دهد که آنها با ترکیب مرجع قابل مقایسه هستند. بنابراین، انتظار یک عملکرد مشابه داریم. با این حال، قطعا نیازمند آزمایشات بیشتر In-vitro است.

کلیدواژه ها:

پروستاگلاندين ها، سيكلواكسيژناز، داروهاي ضدالتهابي غيراستروييدي، تكنيك غربالگري مجازي با كارايي بالا

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/633132/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
حیدرپور صارمی، لیلی و ابراهیمی، علی و لگزیان، میلاد،1396،شناسایی لیدهای قوی جدید برای مهار سیکلواکسیژناز 2 با استفاده از تکنیک غربالگری مجازی با کارایی بالا در بانک اطلاعاتی UNPD،اولین کنفرانس بین المللی یافته های نوین در بیوتکنولوژی،،،https://civilica.com/doc/633132

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1396، حیدرپور صارمی، لیلی؛ علی ابراهیمی و میلاد لگزیان)
برای بار دوم به بعد: (1396، حیدرپور صارمی؛ ابراهیمی و لگزیان)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: دانشگاه دولتی
تعداد مقالات: 9,293
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مقالات پیشنهادی مرتبط

مقالات مرتبط جدید

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

پشتیبانی