مقایسه اجرای الگوریتم موازی کامبت در مطابقت رشته DNA ناحیه کد با دو رابط موازی ساز حافظه اشتراکی و توزیع شده
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 474
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
DCBDP01_062
تاریخ نمایه سازی: 19 خرداد 1396
چکیده مقاله:
در این مقاله سعی داریم تا با استفاده از یک الگوریتم موازی به نام کامبت در سطح DNA پروتیین برای تطابق رشته DNA در ناحیه کد با دو رابط موازی سازOpenMP از نوع حافظه اشتراکی) و MPI از نوع حافظه توزیع شده)، مورد مقایسه قرار دهیم. اما هدف اصلی از ارایه این مقاله این است که کدام یک زمان کمتری را برای تطابق دو رشته DNA ناحیه کد در سطح پروتیین ارایه میدهد. در حالی زمانی اجرای برنامه در هر دو رابطه موازی ساز با تعداد پردانده ای متفاوت مورد بررسی قرار می گردند. تا در پایان این مقاله به هدف اصلی که از کدام یک از این دو رابطه موازی ساز در آزمایشات آینده بروی تطابق دو رشته DNA استفاده نماییم.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
میلاد قاسمزاده
دانشجو کارشناسی ارشد ، دانشگاه امام رضا (ع) مشهد
عبدالرضا سوادی
استادیار ، عضو هیات علمی دانشگاه فردوسی مشهد
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :