پویش ژنومی نشانه های انتخاب در گاومیش های خوزستانی و مازندرانی
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 46، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_IJAS-46-2_002
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 637
نویسندگان
دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد
استاد گروه مهندسی علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
استادیارگروه مهندسی علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
استادیارگروه مهندسی علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
چکیده
شناسایی مناطق ژنومی که هدف انتخاب بودهاند، از بحثبرانگیزترین مباحث در حوزه تحقیقات ژنتیک حیوانی، بهخصوص در حیوانات اهلی است. در این مطالعه، پویش کل ژنوم برای شناسایی مناطقی از ژنوم که در گاومیشهای خوزستانی و مازندرانی هدف انتخابهای طبیعی یا مصنوعی قرار گرفتهاند، اجرا شده است. بدین منظور 141 راس گاومیش رودخانهای شامل جمعیتهای خوزستانی )121راس( و مازندرانی )22 راس(، به وسیله آرایههای ژنومیکی 90K Genotyping Buffalo® Axiom تعیین ژنوتیپ شدند. جهت جستجوی نشانههای انتخاب از برآوردگر نااریب FST( θ )استفاده شد. در مجموع 23 منطقه که نشانگرهای SNP آنها باالتر از 1/0 درصد حد بالای توزیع تجربی FST بود، بهعنوان نشانههای انتخاب شناسایی شده و مورد بررسیهای بیشتر قرار گرفتند. بعد از انطباق مناطق ژنومی انتخابشده با مناطق ژنومی متناظر آن روی ژنوم گاو )Genome Taurus Bos 1.UMD3 ،)24 ژن و 22 QTL شناسایی شد. تعدادی از این ژنها در مطالعات قبلی نیز بهعنوان نشانههای انتخاب گزارش شدهاند. برخی از این ژنها احتمالا در مسیرهای بیولوژیکی که با اهلیشدن حیوانات )توسعه مغز و عملکردهای رفتاری، پیگماسیون و آداپتهشدن به محیط زندگی و شرایط جغرافیایی( و تولید شیرمرتبط میباشند، درگیرند. بررسیها همچنین نشان داد که QTLهای شناساییشده در این تحقیق با صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با راندمان تبدیل غذایی، وزن بدن، چربی زیرپوستی، افزایش وزن روزانه، تیپ، تردی گوشت، ترکیبات شیر، اتصاالت پستانی، اندازه گوساله و گوسالهزایی آسان ارتباط دارند. به هرحال جهت شناسایی نقش دقیق این ژنها و QTLها الزم است مطالعات پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام گیرد.کلیدواژه ها
پویش ژنوم، شاخص تمایز جمعیتی، گاومیش خوزستانی و مازندرانی،نشانههای انتخابمقالات مرتبط جدید
- دانش بوم شناختی سنتی گالش های مازندران در ارتباط با حفاظت از درختان و درختچه -های جنگل های هیرکانی (مطالعه موردی منطقه لفور)
- بررسی اثر ضدباکتریایی دو محصول اسیدیفایر داخلی و خارجی بر روی برخی باکتریهای بیماریزای طیور
- تعیین غلظت عناصر معدنی پرنیاز و کم نیاز در مایع شکمبه ریز کپسوله شده با هیدروکلوئیدهای آلژینات سدیم و کیتوزان
- بررسی امکان کاربرد میکروگانیسم های پروبیوتیک در جیره غذایی به منظور افزایش راندمان تولید در کارگاه های تکثیر و پرورش ماهیان زینتی
- بررسی اثر ضدویروسی عصاره متانولی سرخارگل در کنترل ویروسVZV
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.