بررسی اجزای مؤثر در کمیت و کیفیت DNA ژنومی استخراج شده از گیاه پنبه (Gossypium hirsutum L)

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 785

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

PDCONF01_364

تاریخ نمایه سازی: 11 آبان 1395

چکیده مقاله:

استخراج DNA ژنومی با کمیت و کیفیت مطلوب از نیازهای بنیادی زیست شناسی مولکولی است. در این آزمایش چهار روش استخراج DNA و دو سطح نمونه برگ مورد مقایسه قرار گرفت. پنبه مورد استفاده رقم ورامین بود که از مؤسسه تحقیقات پنبه فراهم گردید. تعیین کیفیت DNA های استخراج شده با استفاده از ژل آگارز در بافر TAE انجام گرفت. تعیین کمیت و کیفیت DNA به روش اسپکتروفتومتری و فاژ لامبدا نیز انجام شد. به منظور انجام PCR، انجام گرفت. تعیین کمیات و کیفیات DNA به روش اسپکتروفتومتری و فاژ لامبدا نیز انجام شد. به منظور انجام PCR، یک جفت پرایمر تخصصی ریزماهواره (BNL3580) براساس مطالعات نگوین و همکاران( 2004 ) انتخاب گردید. واکنش PCR در حجم 10 میکرولیتر انجام گرفت. 5 میکرولیتر از محصولات PCR تولید شده با استفاده از ژل آگارز در بافر TAE به همراه بافر بارگذاری مورد سنج قرار گرفت. برای رویت باندها از اتیدیوم بروماید در لیتر استفاده گردید. تجزیه واریانس اثرات نوع روش استخراج و نوع برگ بر غلظت DNA استخراجی و نسبت جذب هر یک از نمونه ها تفاوت معنی داری را نشان داد. نتایج تجزیه واریانس آزمایشات اسپکتروفوتومتری نشان داد که هم کمیت و هم کیفیت DNA ی استخراجی تحت تأثیر روش استخراج و نوع برگ از لحاظ سن فیزیولوژیکی می باشد. مقایسه میانگین ها نیز نشان داد که DNA ی استخراج شده به روش ژانگ و همکاران (2000) برای برگهای جوان از کمیت و کیفیت بهتری نسبت به سایر روش ها برخوردار بود. در مقدار 1 گرم ماده برگی بیشترین مقدار DNA به میزان 275 نانوگرم بار میکرولیتر باری برگ های جوان و 234 نانوگرم بر میکرولیتر برای برگهای بالغ با روش ژانگ و همکاران بدست آمد. در روش لی و همکاران (2001) اگرچه کیفیت برای برگهای جوان مطلوب بود ولی مقدار DNA حاصله 120 نانوگرم در میکرولیتر بود که نتایج حاصل از الکتروفورز ژل آگارز تصدیق کننده نتایج بدست آمده از روش اسپکتروفوتومتری بود. نتایج حاصل از PCR نشان داد که DNA استخراجی توسط ژانگ و همکاران (2000) از کیفیت لازم برای PCR برخوردار است که وضوح باندها و تعداد باندهای تکثیر شده در مقایسه با سایر روشها در الکتروفورز افقی مؤید این موضوع بود. در نهایت میتوان اذعان کرد که روش ژانگ و همکاران (2000) روشی مناسب برای استخراج DNA از برگ های پنبه می تواند باشد.

کلیدواژه ها:

پنبه ، استخراج ژنوم ، کمیت و کیفیت DNA

نویسندگان

محسن رجبی

گروه گیاهان دارویی، دانشگاه جامع علمی کاربردی، مرکز آموزش جهادکشاورزی، همدان، ایران

عزیز باقری

عضو هیئت علمی مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی همدان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Kadkhodaee, S., 2002. A simple and beneficial method to extract ...
  • Horne, E. C., Kumpatla, S. P., Patterson, K. A., Gupta, ...
  • Lacape J.M., Dessauw D., Rajab M., Noyer J.L, Hau, B., ...
  • Li, H., Lou, J., Hemphill, J. K., Wang, J., GOULD, ...
  • Lopez-Sese, A., ., Staub., J. E., Katzir, N., Gomez- Guillamon, ...
  • Nguyen, T. B., Giband, M., Brottier, P., Risterucci A M. ...
  • Paterson, K. A., Brubaker, C., Wendel J. F., 1993. A ...
  • Zlang, J., Stewart, M. D., 2000. Economical and rapid method ...
  • نمایش کامل مراجع