ارائه روش جدید به منظور ساخت شبکه تنظیم ژن بر اساس روش های خوشه بندی سلسله مراتبی فازی

ساخت شبکه های تنظیمی ژنتیکی عبارت است از یادگیری ارتباطات بین ژن ها، و یا مداراتی که در تنظیم شرایط سلول در پاسخ به محرک های داخلی یا خارجی نقش دارند. در واقع هدف این است که شبکه ای از ارتباطات بین ژن ها را یاد بگیریم، که تعیین می کنند کدام ژن ها، مسئول فعال کردن مجموعه ای ازژن های دیگر می باشند. با استفاده از کشف این ارتباطات می توان ژن های موثر در یک بیماری را شناسایی کرد همچنین می توان در زمینه طراحی دارو استفادهنمود. مهمترین محدودیت در استنتاج شبکه تنظیم کننده ژن، کم بودن تعداد نمونه ها، امکان نفوذ نویز و تعداد زیاد ژنها می باشد ومدل های مختلفی جهت ساخت شبکه تنظیم کننده ژن وجود دارد. در این مقاله، از روش خوشه بندی سلسله مراتبی فازی برای استنتاج شبکه تنظیم کننده ژن، استفاده شده است. با استفاده از خوشه بندی ژن های شبیه به هم در یک خوشه قرار می گیرد با این کار بسیاری از یالها از بین می روند و ارزیابی های نهایی نشان می دهد که خوشه بندی ژن ها کارایی روش های استنتاج شبکه تنظیم ژن را بالا می برد

کلیدواژه ها:

آنالیز مولفه های اصلی ، سر خوشه ، خوشه بندی ، شبکه تنظیم ژن