ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

Molecular modelling analysis of retro-inverso (RI) peptides in association with MHC class II molecules

سال انتشار: 1384
کد COI مقاله: NBCI04_231
زبان مقاله: انگلیسیمشاهد این مقاله: 1,702
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای 6 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله Molecular modelling analysis of retro-inverso (RI) peptides in association with MHC class II molecules

Alireza Haghparast - Immunology Section, Department of Pathobiology, Faculty of Veterinary Medicine, Ferdowsi University of Mashhad
Ed E Moret - Department of Medicinal Chemistry, Utrecht Institute for Pharmaceutical Sciences, Faculty of Pharmacy, Utrecht University.

چکیده مقاله:

In an effort to understand the different biological properties of natural L and retro-inverso (RI) peptides in complex with MHC class II molecules, we analysed the molecular interaction patterns and conformational behaviour of the RI-peptides with MHC class II molecules. By homology to the crystal structure of the human leukocyte antigen DR1 (HLA-DR1) complexed with influenza haemagglutinin epitope (HA) a model for the bovine leukocyte antigen BoLA-DRB3*0201 was built. The foot and mouth disease virus (FMDV) derived peptides with strongest MHC binding and T cell proliferative capacity were selected for modelling and minimisation. The non-bonded interaction energy between MHC and ligand was slightly less in RI-complexes when compared with L complexes. However, the internal bonded energy of the RI-peptides showed considerable conformational strain. Furthermore, we postulated that the RI-peptides should be able to adopt a reversed orientation in the groove in order to mimic their natural L-counterparts. To investigate the hypothesis that, RI-peptides might prefer their secondary structure in a right handed (RH) polyproline twist, rather than the left handed (LH) polyproline type II twist, we forced them into a RH twist and analysed their interaction patterns. Interestingly, these data support our idea that, the RH conformation is the preferred conformation for RI-peptides. This however, disrupts the mimicry and abolishes most interactions with MHC. This may explain our earlier observation that, RI-peptides were not able to mimic their parent L peptides in terms of interaction with MHC class II molecules.

کلیدواژه ها:

Molecular modelling, Retro-Inverso (RI) Peptides, MHC class II molecules, Polyproline twist

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/45302/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Haghparast, Alireza و Moret, Ed E,1384,Molecular modelling analysis of retro-inverso (RI) peptides in association with MHC class II molecules,چهارمین همایش ملی بیوتکنولوژی ایران,کرمان,,,https://civilica.com/doc/45302

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1384, Haghparast, Alireza؛ Ed E Moret)
برای بار دوم به بعد: (1384, Haghparast؛ Moret)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود ممقالهقاله لینک شده اند :

  • .WcFarland, B. J., C. Beeson, and A. J. Sant. 1999. ...
  • .Weziere, C., M. Viguier, H. Dumortier, R. Lo-Man, C. Leclerc, ...
  • .Wikko, S., K. Roed, S. Schmutz, and L. Andersson. 1999. ...
  • .Worgan, B. P., J. M. Scholtz, M. D. Ballinger, I. ...
  • .Wurthy, V. L., and L. J. Stern. 1997. The class ...
  • O stankovitch, M., G. Guichard, F. Connan, S. Muller, A. ...
  • Petit, M. C., N. Benkirane, G. Guichard, A. P. Du, ...
  • Russell, G. C., C. J. Davies, L. Andersson, S. A. ...
  • Saito, N. G., and Y. Paterson. 1997. Contribution of peptide ...
  • Scherf, T., R. Hiller, F. Naider, M. Levitt, and J. ...
  • Shemyakin, M. M., Y. A. Ovchinnikov, and V. T. Ivanov. ...
  • Siligardi, G., and A. F. Drake. 1995. The importance of ...
  • Stern, L. J., J. H. Brown, T. S. Jardetzky, J. ...
  • Verdoliva, A., M. Ruvo, G. Cassani, and G. Fassina. 1995. ...
  • Vriend, G. 1990. WHAT IF: a molecular modeling and drug ...
  • Wermuth, J., S. L. Goodman, A. Jonczyk, and H. Kessler. ...
  • Wilson, I. A., and R. L. Stanfield. 1994. Antibo dy-antigen ...
  • مدیریت اطلاعات پژوهشی

    صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

    اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: دانشگاه دولتی
    تعداد مقالات: 26,185
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    مقالات مرتبط جدید

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

    پشتیبانی