بررسی فیلوژنیک گونه های خانواده Penaeidae به روش تعیین توالی ژن mt-DNA در آب های شمالی خلیج فارس

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 556

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

KMSU01_142

تاریخ نمایه سازی: 1 آذر 1394

چکیده مقاله:

به منظور مطالعه فیلوژنتیکی میگوهای خانواده Penaeidae سواحل بحرکان ، از روش تعیین توالی ژن 16S rRNA استفاده شد. استخراج DNA از عضله پای شنا میگوها باروش CTAB انجام شد. قطعه ژنی 16S rRNA با استفاده از آغازگرهای جهانی 16Sar/16Sbr تکثیر گردید. گرچه بعد از نمونه برداری میگوی Metapenaeus sp. به عنوان گونه M. affinisشناسایی و جداسازی شد ولی Blast نتایج حاصل از تعیین توالی ژن 16S rRNA نشان داد که توالی مورد نظر به طور کامل با ژن 16S rRNA گونه M. monoceros منطبق می باشد. همچنین آنالیزهای بیشتر با استفاده از نرم افزار MEGA Ver. 5 نتیجه به دست آمده را تایید کرد. نتایج حاصل از هم ردیفی توالی های M. monoceros با استفاده از نرم افزارClustal W نشان دهنده 17 مکان پلی مورفیسم بود که از این تعداد 10 مکان پارسیمونی تشخیص داده شدند. نتایج هم ردیفی توالی 16S rRNA گونه P. stylifera، 14 مکان پلی مورف و 4مکان پارسیمونی را نشان داد. نتایج حاصل از نرم افزار Arlequin Ver 3 تنوع هاپلوتیپی را برابر 1 نشان داد. این توالی ها غنی از تیمین و ادنین (64/2 درصد) بودند. میزان شاخص R،1/418 و میانگین واگرایی این دو گونه از هم 10/9 درصد محاسبه شد. براساس نرخ موتاسیون دو درصد به ازای هر میلیون سال برای mtDNA زمان اشتقاق این دو گونه از هم پنج میلیون و چهار صد و پنجاه هزار سال پیش تخمین زده شد.

نویسندگان

مرضیه نصراله زاده

گروه بیولوژی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر

محمد علی سالاری علی آبادی

گروه بیولوژی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر

نسرین سخایی

گروه بیولوژی دریا، دانشکده علوم و اقیانوسی، دانشگاه علوم وفنون دریایی خرمشهر

حسین ذوالقرنین

گروه بیولوژی دریا، دانشکده علوم دریایی واقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • (1) بابایی، س. ع، 1380. بررسی مولکولی جمعیت سه گونه ...
  • (3) صفی خانی، ا، 1377. گزارش نهایی شناسایی و تعیین ...
  • (4) Chu, K., Ho, H., Li, C., and Chan, T., ...
  • (5) Cunningham, C.W. Blackstone, N.W. and Buss, L.W., 1992. Evolution ...
  • (6) Daniels, S. R., Stewart, B. A., Gouws, G., Cunningham, ...
  • (7) Fast, A.W., Lester, J. (Eds.)., 1992. Marine Shrimp Culture: ...
  • (8) Gillham, N.W., 1994. Organelle Genes and Genomes, Oxford University ...
  • (9) Haye, P. A., Tam, Y. K., and Kornfield, I., ...
  • (10) Knowlton, N., 1993. Sibling species in the sea. Annual ...
  • (11) Ma, K.Y. Chan, T.Y., and Chu, K. H., 2009. ...
  • (12) Sarver, S. K. and Foltz, D. W., 1993. Genetic ...
  • (13) Taggart, J. B., Hynes, R. A., Prodohl, P.A. and ...
  • (14) Tong, J.G., and Chan, T.Y. _ Chu, K.H., 2000. ...
  • نمایش کامل مراجع