هومولوژی و پیش بینی منطقه عملکردی در ژن ها ی CYP3A4 و CYP2D6 و مقایسه آنها درانسان، گاو، مرغ
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 589
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
RSTCONF01_407
تاریخ نمایه سازی: 30 آبان 1394
چکیده مقاله:
در این پژوهش سعی بر آن بوده است تا با استفاده از علم بیوانفورماتیک به بررسی انواعی از سیتوکروم ها که نقش در متابولیسم داروهاهم در انسان و هم در مدل های حیوانی دارند، بپردازیم. در این راه با استفاده از توالی مولکول های mRNA مربوط به هر ژن و اگزون های آنها به بررسی هومولوژی بین نواحی کدینگ ژن و پروتئین مربوط به هر کدام پرداخته شد. بنابراین ابتدا توالی ژن ها و پروتئینهای رفرنس مربوط به CYP3A4 و CYP2D6 که در پایگاه داده ای مرکز ملی بیوتکنولوژی داده ها 1 وجود دارد، برای سه جاندار شامل انسان، گاو و مرغ بازیابی شد و بلست انجام گرفت. نتایج بلست به ترتیب امتیاز نشان داد که رونوشت ژن CYP3A4 در مرغ و گاوبا رونوشت ژن CYP3A22 در شتر به ترتیب 33 % و 58 % و رونوشت ژن CYP2D6 مربوط به گاو با سه رونوشت مختلف از همین ژن در انسان به ترتیب 83و84درصد و با رونوشتCYP2D14 در شتر 56 % شباهت داشتند. همچنین رونوشت ها و اگزون ها ی مربوط به سه جاندار ذکر شده برای هر دو ژن CYP3A4 و CYP2D6 از پایگاه NCBI بازیابی شده و توسط نرم افزار CLC Genomic از نظر همولوژی، مقایسه وآنالیز همترازی انجام شد. نتایج تحقیق حاضر نشان دادکه این دو ژن در سه گونه دارای ارتباط تکاملی بوده و در بخش های عملکردی میزان شباهت و حفاظت بازها در توالی نوکلئوتیدی و اسیدآمینه ها در توالی های پروتئینی مربوط، در سطح معنی داری می باشد
نویسندگان
ژیلا حسانی
دانشجوی دکترا رشته ژنتیک و اصلاح نژاد، دانشگاه فردوسی مشهد )پردیس بین الملل(، دانشکده کشاورزی، گروه علوم دامی
محمدرضا نصیری
استاد، دکترای ژنتیک و علوم دامی، مشهد، میدان آزادی، بلوار وکیل آباد، دانشگاه فردوسی مشهد، دانشکده کشاورزی، گروه علوم دامی
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :