پیش بینی بر همکنش پروتئین-پروتئین مبتنی بر الگوریتم رقات استعماری(ICA)
محل انتشار: هفتمین کنفرانس بین المللی فناوری اطلاعات و دانش
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 913
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICIKT07_173
تاریخ نمایه سازی: 22 مهر 1394
چکیده مقاله:
یکی از مهمترین مسائلی که در حوزه ی بیوانفورماتیک مورد مطالعه قرار می گیرد، بحث پروتئین ها و به خصوص رسیدن به یک درک عمیق از عملکرد پروتئین های موجود در یک ارگانیزم است. در این مقاله از مجموعه داده های پروتئینی برای پیش بینی برهمکنش های پروتئین-پروتئین استفاده شده است. از جمله ویژگی های داده پروتئینی می توان به طول بزرگ بردارهای ویژگی ونویزی بودن آن ها اشاره کرد. در این مقاله از SVM به عنوان دسته بند دقیق جهت پیش بینی برهمکنش پروتئین ها استفاده کرده ایم. با توجه به تأثیر مستقیم انتخاب ویژگی و پارامترهای بهینه SVM در وقت پیش بینی سعی کردیم تا با انتخاب همزمان بهترین ویژگی ها و پارامترهای SVM دقت را افزایش دهیم. مسئله انتخاب ویژگی و بهینه سازی پارامترهای SVM به صورت همزمان، یک مسئله NP-Hard است و یکی از رویکردهای مناسب حل این مسئله، الگوریتم های تکاملی هستند. ما با یکی از انواع این الگوریتم ها یعنی الگوریتم رقابت استعماری(ICA) اهداف خود را پی گیری نمودیم. نتایج ارزیابی نشان دهنده مؤثر بودن رویکرد انتخابی است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
محمد گنجی
دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر-نرم افزار دانشگاه تربیت مدرس
یوسف عبدالعزیز
دانشجوی دکتری مهندسی کامپیوتر-نرم افزار دانشگاه تربیت مدرس
نصرالله مقدم چرکری
عضو هیئت علمی گروه کامپیوتر دانشگاه تربیت مدرس
محمد صنیعی آباده
عضو هیئت علمی گروه کامپیوتر دانشگاه تربیت مدرس
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :