بررسی ساختار و جایگاه پروتئین ژن Vpx در بیماری گامبو رو

طی سال های اخیر سویه های بسیار بیماری زایی ازویروس گامبورو باعث تلفات شدید و زیادی درجوجه ها و به خطر افتادن وایجاد نگرانی و خسارت اقتصادی در صنعت ماکیان درجهان شده است، ویروس دارای دو قطعه است که قطعه A یک پلی پروتئین 109kd را کد می کند که ارائه کننده سه پپتید VPX,VP3,VP4 است که VPX تولید یک پلی پپتید شناخته شده به نام VP2 را می کند که همراه با VP3 تشکیل کپسید ویروس را می دهند. در میان این پروتئین ها، VP2 حاوی مکان های آنتی ژنی مهمی است که باعث ایمنی به واسطه تولید آنتی بادی های خنثی کننده می شوند. در این تحقیق نمونه های از مرغ دارهای شهرستان اراک تهیه و به موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی شعبه منطقه مرکزی کشور(اراک) انتقال داده شد. RNA نمونه ها استخراج شده و با استفاده از پرایمر های طراحی شده برای ژن VPx ، PCR شدندو نمونه هایی که آلوده به این ویروس بودند شناسایی شدند و ژن VPx شناسایی شده از نمونه های آلوده در TA وکتور کلون شد.توالی کلون شده، توالی یابی شد وساختار این توالی مورد بررسی بیوانفورماتیکی قرار گرفت. در این تحقیق بعد از ترجمه قظعه توالی یابی شده به پروتئین با استفاده از نرم افزار توالی 516 آمینو اسیدای این پروتئین مورد بررسی ساختاری قرار گرفت و مشخص شد ساختار ثانویه این توالی دارای 22 رشته امتداد یافته 4 مارپیچ آلفا و همچنین 13 پیچ می باشد و نیز قسمت های درون غشایی این پروتئین مشخص شد.

کلیدواژه ها:

ژنVPx ، بیماری IBD ، کلون ژن ، ساختار پروتئین VPx ، جایگاه پروتئین در سلول