مطالعه خصوصیات فیزیک و شیمیایی و تعیین جایگاه فیلوژنتیکی دومن شاخص آنزیم نوکلئاز PARS II

نوکلئازهای خانواده S1/P1 دسته ای از آنزیم های نوکلئاز می باشند که بافعالیت اختصاصی خود، مولکول های اسیدنوکلئیک تک رشته ای و همچنین نواحی تک رشت ای موضعی در مولکول های دو رشته ای را هدف قرار می دهند. این نوکلئازها به طور گسترده در مطالعات تعیین ساختمان مولکولی اسیدهای نوکلئیک، نقشه یابی جهش ها و ردیابی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی مورد استفاده قرار می گیرند. تمام نوکلئازهای این خانواده، صرف نظر از توالی های سیگنال پپتید در دو انتهای آمین و کربوکسیل، دارای یک دومن شاخص موسوم به دومن S1/P1 می باشند که این دومن در حقیقت، توالی بالغ پروتئین را تشکیل می دهد. علاوه براین ، دومن شاخص در تمام نوکلئازهای این خانواده دارای مناطق و جایگاه های فعال ویژه ای می باشدکه به صورت حفاظت شده باقی مانده اند. در تحقیق حاضر، خصوصیات فیزیک وشیمیایی و جایگاه فیلوژنتیکی دومن شاخص توالی ژنی نوکلئاز PARS II از خانواده S1/P1 که به تازگی از گیاه جعفری جداسازی گردیده است. در مقایسه با مهم ترین و شناخته شده ترین اندونوکلئازهای اختصاصی تک رشته مورد بررسی قرار گرفت. بررسی های انجام شده نشان داد که این نوکلئاز با دارا بودن تمام ویژگی ها و مشخصه های خاص اندونوکلئاز های خانواده S1/P1، از دیدگاه فیلوژنتیکی به زیر گروه اندونوکلئازهای اختصاصی DNA هترودوپلکس تعلق دارد.

کلیدواژه ها:

نوکلئازهای اختصاصی تک رشته ، دومن شاخص ، خصوصیات فیزیک وشیمیایی ، بررسی فیلوژنتیکی