مطالعه فیلوژنتیکی سودوموناس فلورسانس تولید کننده گالاکتوز دهیدروژناز و آنالیز بیوانفورماتیکی آنزیم جهت شناسایی دنباله های آمینواسیدی جایگاه فعال

زمینه و هدف: گالاکتوز دهیدروژناز، آنزیمی از خانواده دهیدروژنازها است. این آنزیم با تعیین واندازه گیری اختصاصی گالاکتوز 1- فسفات، نقش مهمی درطراحی وساخت کیت های غربالگری بیماری گالاکتوزمی دارد.هدف از این تحقیق، جداسازی و تعیین مشخصات میکروارگانیسم های تولید کننده گالاکتوز دهیدروژناز ازنمونه های بومی ایران بود. روش ها: غربالگری آنزیم ازنمونه های خاک و آب جمع آوری شده از مناطق ساحلی استان هرمزگان انجام گرفت. میکروارگانیسم جداسازی شده توسط واکنش های بیوشیمیایی،آنالیز ژنهای RNA ریبوزومی 16S و رسم درخت فیلوژنتیکی تعیین مشخصات گردید. مطالعات کینتیکی برروی آنزیم شناسایی شده انجام شد و ساختار سه بعدی آن توسط روش های بیوانفورماتیکی شبیه سازی گردید. نتایج: در بین 400 میکروارگانیسم جداسازی شده، تنها یک سوش باکتری، فعالیت گالاکتوز دهیدروژناز از خود نشان داد. سویه باکتری با استفاده از آنالیز فیلوژنتیکی ژن های RNA ریبوزومی 16s به عنوان بیوتایپ جدیدی از سودوموناس فلورسانس شناسایی شد. ساختار سه بعدی شبیه سازی شده از آنزیم مذکور نیز قرار داشتن گالاکتوز دهیدروژناز جداسازی شده در آنزیم های خانواده سودوموناس فلورسانس را تایید نمود. درمجموع، آنزیم گالاکتوز دهیدروژناز از بیوتایپ جدیدی از سودموناس فلورسانس جداسازی شده از نمونه های بومی ایران، شناسایی و بررسی شد. آنزیم مذکور باتوجه به خصوصیات کینیتکی می تواند از پتانسیل مناسبی دراندازه گیری گالاکتوز1- فسفات و استفاده در کیت برخوردار باشد.

کلیدواژه ها:

غربالگری ، گالاکتوز دهیدروژناز ، سودموناس فلورسانس