بررسی نواحی کروموزومی و شناسایی لوکوس های اطراف ژن های درگیر در انتقال یون های سدیم و پتاسیم در آرابیدوپسیس، برنج و Physcomotrella patent

تعیین دقیق ارتولوژی در مطالعات ژنومیکس بسیار ضروری است و این مساله از دیرباز به عنوان یک چالش در سیستم بیولوژی بر پایه اندازهگیری میزان همولوژی بین ژنهای نزدیک عمل میکند. شناسایی و in silico synteny . مطرح بوده است میتواند فرصت به دست آوردن اطلاعات ژنتیکی از طریق مقایسه نواحی synteny مقایسه نقشههای ژنتیکی از طریق کروموزومی طی وقایع سیتوپلاسمی ژنوم که در مسیر تکامل منجربه تشکیل ساختار ژنوم شده است را به وجود آورد. این از HKT وقایع به لحاظ تکاملی مسوول تشکیل فنوتیپ در بین سایر گونهها هستند. شناسایی ژنهای اطراف ژنهای در سایت in silico synteny مهمترین ژنهای درگیر در انتقال یونهای سدیم و پتاسیم طی تنش شوری بهوسیله ی نشان داد که synteny صورت گرفت. نتایج بهدست آمده از آنالیز (phytozomewww.phytozome.net) فیتوزوم حضور دارند که Physcomotrella patent در برنج، آرابیدوپسیس و HKT چندین لوکوس ناشناخته در نزدیکی ژنهای از (ABA) در تنش شوری دخیلند. نتایج همچنین اثبات کرد که هورمون آبسیزیک HKT به احتمال زیاد شبیه ژنهای است که این امر نتایج بررسی قبلی ما را در مطالعه نواحی پروموتری ژنهای HKT مهمترین محرکهای ژنهای اطراف HKT در طول هر کروموزوم هم مشابه HKT تایید میکند. بنابراین این احتمال وجود دارد که ژنهای نزدیک HKTباشند که در آینده نزدیک HKT باشند و یا ممکن است این لوکوسهای ناشناخته ایزوفرمهای جدیدی از همین ژنهای معرفی خواهند شد.

کلیدواژه ها:

آبسیزیک اسید ، ، ارتولوژی ، in silico synteny ، HKT