تعیین جایگاه تاکسونومیکی ویروس موزاییک کوتولگی ذرت جدایه استان گلستان در میان پوتی ویروسهای غلات بر اساس ترادف نوکلئوتیدی ژن پروتئین پوششی

ویروس موزاییک کوتولگی ذرت Maize dwarf mosaic virus, MDMV یکی از مهمترین و گستردهترین پوتی ویروس های ذرت در دنیا میباشد. بمنظور تعیین جایگاه تاکسونومیکی ویروس جدایه استان گلستان در میان پوتی ویروسهای غلات و خاستگاه ویروس و قرابت آن با سویههای سایر کشورها، گیاهان ذرت و قیاق با علائم موزاییک و MDMV و سایر سویه های با آنتی سرم این MDMV کوتولگی در سال زراعی 1389 از مزارع استان گلستان جمع آوری شدند. نمونه های آلوده به ویروسی آن استخراج RNA انتخاب و MDMV ویروس در آزمون الایزای غیر مستقیم مشخص شدند. یک نمونه آلوده به تکثیر RT-PCR به روش MDMV گردید، سپس ناحیه ‘ 3 ژنوم آن با استفاده از آغازگرهای دژنره پوتیویروسها و اختصاصی قطعهای به طول 1126 نوکلئوتید بود این ترادف با ترادف سایر ،CP-UTR و همسانه سازی گردید. ترادف استنتاجی ناحیه و نیز دیگر پوتیویروسهای غلات مورد مقایسه قرار گرفت و درخت فیلوژنتیکی Gen Bank موجود در MDMV جدایه های SrMV بدست آمد. در این آنالیز فیلوژنتیکی، 43 ترادف در 6 گروه شامل neighbor-joining حاصل از این ترادفها به روش قرار گرفتند و جدایه گلستان در کنار جدایهای از کشور بلغارستان MDMV و SCMV ، JGMV ، PenMV ، ZeMV ، گروه مشترکی تشکیل دادند.

کلیدواژه ها:

RT-PCR ، آنالیز فیلوژنتیکی ، خاستگاه ویروس ، آغازگرهای دژنره