آنالیز بیوانفورماتیکی ژنIGF-1در پنج گونه دام اهلی

فاکتور رشد شبه انسولین نوع 1 یا همان سوماتومدینc بیشتر در کبد و دیگر بافتها تحت تاثیر هورمون رشد سنتز میشود. این هورمون نقش مهمی در رشد و نمو سلولها و بسیاری از فرآیندهای فیزیولوژیک بدن مانند تولید مثل و سیستم ایمنی دارد. با توجه به نقشی که اینژن در تکثیر سلولها و رشد حیوانات دارد به عنوان یک ژن کاندیدای مهم در بررسی صفات رشد و تولید گوشت مطرح است. در این پژوهش توالیmRNAاین ژن در پنج گونه دام اهلی شامل گوسفند، گاو، بز، اسب و مرغ مورد بررسی قرار گرفت و تعدادی از توالیهای ژنی و پروتئینی آنها از بانک ژن بازیابی و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. آنالیز همولوژی و هم ترازی، فیلوژنی، بررسی تنوع در طول ناحیه کد کننده و تنوع در کدون پایانی، همچنین تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی این گونهها با استفاده از نرم افزار هایBio EditوDna sp (ver و( 5.10.01 Mega 5انجام گرفت. بررسی و مقایسه توالیهای پروتئینی کمک فراوانی به فرضیه تکامل میکند. آنالیز تنوع ژنتیکی نشان داد که گونهیCapra hircusبیشترین تنوع را نسبت به سایر گونههای مورد بررسی دارد. استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیک به منظور درک بهتر ساختار ژن 1IGF-پروتئین و روشنتر شدن عملکرد آن ضروری است.

کلیدواژه ها:

آنالیز بیوانفورماتیک ، آنالیز فیلوژنی ، تنوع ژنتیکی ، ژنIGF-1