ارزیابی بیان microRNAهای کاندیدا در پاسخ لیموترش به دو سویه از باکتری جنسXanthomonas

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 666

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_1194

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

باکتری بیماریزای گیاهیXanthomonas citri subsp. citri به عنوان عامل شانکر باکتریایی مرکبات محسوب میشود که به طور شدیدی تولید همه ارقام مرکبات را کاهش میدهد. در نتیجه دو پدیده رشد و تقسیم بیش از حد سلولی، شانکر مرکبات با علائمی چون جوشهایآبسوخته و زخمهای دوار و چرکدار مشخص شده و بر روی هر سه اندام برگ، گل و میوه ظاهر خواهند شد. یکی از مولکول های تنظیمی قابل ملاحظه در کنترل تغییرات پس از رونویسیmicroRNAبالغ با قابلیت تنظیم سطح رونوشت ژنها در پاسخ به متغیرهای مکان و زمان است. در طی دههی گذشته microRNA ها به عنوان عناصر اصلی در برهمکنش گیاه-پاتوژن شناخته شدهاند. جداسازی و شناسایی این مولکولها بوسیله روشهای مرسوم RT-PCRبه دلیل اندازه کوتاه و مقدار کم آنها در سلول دچار مشکل است Stem-loop RT-PCRبه عنوان روشی حساس و اختصاصی میتواند برای تشخیصmiRNA های بسیار حفاظت شده گیاهان غیرمدل مورد استفاده قرار گیرد. در این تحقیق سه توالی احتمالی miRNA بر اساس همولوژی انتخاب و همولوگهای احتمالی آنها در گیاه لیمو ترش (Citrus × limon) با استفاده از روشstem-loop RT-PCRبا موفقیت تکثیر شدند. علاوه بر این بیان در طی زمان اینmiRNAهای احتمالی در پاسخ لیمو ترش به دو استرین متعلق به گونههای جنسXanthomonas ردیابی شد. نتایج نشان داد که در نتیجه آلودگی استرینهای مختلف در یک گیاه، سطوح بیان ژن به طور متفاوتی در طی زمانهای مختلف پس از آلودگی تغییر میکند. همچنین مشاهده شد که 6 ساعت پس از ایجاد آلودگی زمان حیاتی در برهمکنش لیمو ترش و Xanthomonas است. الگو های بیانی متفاوتmir159 در پاسخ به استرینهای مورد مطالعه حاکی از نقش موثر آن در ایجاد پاسخ فوق حساسیت دارد. اگرچه نشان داده شد کهmir167 ظاهراً نقش موثری در ایمنی اولیه گیاه تحت آلودگی استرینA دارد اما دارای الگویی غیر پاسخگو در طی پاسخ فوق حساسیت است. بر اساس الگوهای بیانیmir398 ما پیشنهاد کردیم که اثر متغیر زمان بر روی بیان این microRNA بیش از اثر نوع استرین مهاجم است.

نویسندگان

میلاد علیزاده

دانشگاه شهید بهشتی، دانشکده مهندسی انرژی و فناوریهای نوین، گروه بیوتکنولوژی

حسین عسکری

دانشگاه شهید بهشتی، دانشکده مهندسی انرژی و فناوریهای نوین، گروه بیوتکنولوژی

مسعود سلطانی نجف آبادی

موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر کرج

اسماعیل رجایی

دانشگاه شهید بهشتی، دانشکده مهندسی انرژی و فناوریهای نوین، گروه بیوتکنولوژی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • کشاورزی، و0ج. (1389). "شناسنامه تصویری مرکبات". ...
  • رجایی، ا.، (1391). "بررسی بیان ژن‌های کاندیدا در مرگ برنامه ...
  • Brunings, A. M., Gabriel, D.W. (2003). "Xanthomonas citri: breaking the ...
  • Cernadas, R. A., Camillo, L. R., Benedetti, C. E. (2008). ...
  • Chen, C., Ridzon, D. A., Broomer, A. J., Zhou, Z., ...
  • _ Hofrichter, M. (2010). "Industrial Applications". Springer. p. 224. ISBN ...
  • Jagad eeswaran, G., Saini, A., Sunkar, R. (2009). "Biotic and ...
  • Jia, X., Wang, W-X., Ren, L., Chen, Q-J., Mendu, _ ...
  • Perez- Clemente, R. M., Vives, _ Zandalinas, S. I., Lopez- ...
  • _ _ _ _ _ _ _ of cassava miRNAs ...
  • Pfaffl, M.W. (2001). "A new mathematical model for relative quantification ...
  • Robinson, .J. (2002). "Biotic stress and biotechnology" _ The Plant ...
  • Ruijter, J. M., Ramakers, C., Hoogaars, W. M. H., Karlen, ...
  • Sunkar, R., Li, Y-F., Jagad eeswaran, G. (2012). "Functions of ...
  • Varkonyi- Gasic, E., Wu, R., Wood, M., Walton, E. F., ...
  • Viloria, Z., Drouillard, D. L, Graham, JI. H., Grosser, J. ...
  • Voinnet, O. (2009). "Origin, biogenesis, and activity of plant microRNAs" ...
  • Zhang, W., Gao, S., Zhou, X., Chellappan, P., Chen, Z., ...
  • نمایش کامل مراجع