بررسی بیوانفورماتیکی و تائید آزمایشگاهی یکmiRNAی جدید در ناحیه ژنیBrcA2

ها RNA ، (miRNA) microRNA غیرکدکنندهی کوچک 18-22 نوکلئوتیدی هستند که با اتصال به΄UTR3 ترانسکریپت هدف نقش تنظیمی مهمی در فرایندهای مختلف سلولی ایفا می کنند. تومورهای پستان از رایج ترین سرطان های زنان می باشند که ژن BrcA2در پاتوژنز این بیماری نقش مهمی ایفا می کند. ژنBrcA2 با توجه به شایع بودن وقوع حذف در این ناحیه ی ژنی در سرطان سینه به عنوان ژن هدف برای شناساییmiRNAهای جدید انتخاب شد. این ناحیه توسط الگوریتم های مختلف بیوانفورماتیکی از حیث وجود ساختارهای سنجاق سری واجد ویژگی هایmiRNA مورد بررسی قرار گرفت. ساختارهای سنجاق سری شناسایی شده توسط نرم افزارهایMicroprocessor SVM و CID-miRNA ،MiPredمورد آنالیز قرار گرفتند. در نهایت با توجه به نتایج آنالیزها و میزان حفاظت شدگی نواحی، یک ساختار سنجاق سری به منظور بررسی آزمایشگاهی انتخاب شد. سپس ناحیه ی مورد نظر در وکتوربیانی PEGFP–C1کلون و در رده ی سلولی Hela بیش بیان شد. کارآیی ترانسفکشن با استفاده از بیان گزارشگرGFPتایید و نهایتا سلولهای ترانسفکت شده با وکتور بیانی حاوی قطعه مورد نظر و سلول های کنترل جهت شناساییmiRNAبالغ، مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج بدست آمده حاکی از ورود موفق وکتور بیانی به سلول های Helaی ترانسفکت شده و پردازش ناحیه مورد نظر می باشد. با توجه به شیوع حذف این ناحیه کروموزومی در سرطان سینه به نظر می رسد با شناساییmiRNAی جدید بالقوه در این ناحیه و بررسی عملکرد آن بتوان گام مهمی در شناسایی بیومارکری جدید در سرطان سینه برداشت.

کلیدواژه ها:

سرطان سینه ، ژنmiRNA ، BrcA2 ، آنالیز بیوانفورماتیکی