آنالیزمولکولی و توالی یابی گونهAphelenchus avenae (Nematodae: Aphelenchidae)از ایران و موقعیت فیلوژنتیکی آن بر اساس دامنهD2-D3 ژن28SrDNA

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 821

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0797

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

نماتدAphelenchus avenaeدر حین نمونه برداری از شهرستان بیرجند در استان خراسان جنوبی جداسازی و بر اساس ویژگی های مرفولوژیک و مرفومتریک شناسایی گردید. به منظور مطالعات دقیق تر، قطعهD2D3 ناحیه ژنیSrDNA28 با استفاده از پرایمرهای اختصاصی تکثیر و توالی یابی شد. مقایسه توالی نمونه با اطلاعات بانک ژنNblast نشان داد که جمعیت مورد مطالعه با جمعیت هایی از گونهAphelenchus avenaeاز کشور چک ( 348400JQ و ژاپن ( 368536ABبه ترتیب 98 و97/5 درصد شباهت نشان میدهد. در آنالیز فیلوژنتیک به روشNeighbor joining و Maximum parsimonyاین جمعیت به همراه جمعیت های دیگرA.avenaeدر یک شاخه (کلاد) با ارزش بوتستراپ به ترتیب 100 و 99 درصد قرار گرفت. نتایج آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد که جنس Aphelenchusیک گروه مونوفیلتیک می باشد. در این تحقیق موقعیت فیلوژنی این گونه از ایران با سایر نماتدهای هم گروه مورد بررسی قرار گرفت. ناحیه28SrDNA ژن D2-D3 از گونهAphelenchus avenaeبرای اولین بار از ایران گزارش می گردد.

نویسندگان

سمیه الوانی

گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

عصمت مهدیخانی مقدم

گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

حمید روحانی

گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

عباس محمدی

گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Karegar, A., Geraert, E. , & Kheiri, A. (1995). "Tylenchus ...
  • Kheiri, A. (1972). "Plant parasitic nematodes (Tylenchida) from Iran". Biological ...
  • Rafiee, H., Mahdikhani Moghadam, E., & Najafiniya, M. (2011).، Identification ...
  • Subbotin, S. A., Sturhan, D., Chizhov, V. N., Volvas, N., ...
  • Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M., ...
  • Teymori, F., Nori, P. 2003. Introduce of some plant parasitic ...
  • نمایش کامل مراجع