ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

مدلسازی مقایسهای آنزیم β-گالاکتوزیداز باکتریCohnella A01 و اعمال جهش نقطهای به منظور افزایش پایداری حرارتی و فعالیت کاتالیزوری

محل انتشار: اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 607

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/328368

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0698

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

آنزیمهایb-گالاکتوزیداز کاربردهای فراوانی در صنایع مختلف ازقبیل صنایع غذایی و نوشابهسازی دارند. در این پروژه آنزیمβ-گالاکتوزیداز از باکتریCohnella A01مدلسازی شد. برای مدلسازی از چهار سرورswissmodel,ps2,SAM- وphyre2T08 استفاده شد. مدلهای پیشبینی شده به عنوان الگو برای ساخت مدل نهایی با 9.8 Modeller v: مورد استفاده قرار گرفت. مدلنهایی از لحاظ سطح انرژی به حد اقل رسانیده شد و جایگاه فعال آنزیم شناسایی گردید. اسید آمینه های اسید گلوتامیک 156 و 352 بهعنوان اسید های آمینه اصلی جایگاه فعال شناسایی شدند.انرژی به دست آمده حاصل از داک گذاری اولیه در مقیاس سیستم امتیاز دهی MolDockبرابر با103/30-بود. سپس با اعمال 100 جهش نقطهای و ساخت مدلهای جهشیافته و انجام شبیه سازی داک گذاری سه مدل جهش یافتهD312W و P190I ،E145Lبا انرژی بیشتری به جایگاه فعال آنزیم متصل شده و باعث افزایش فعالیت کاتالیزوری آنزیم شدند.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

فریده حاجیان

پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری .دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم دارویی

ابراهیم ترکتاز

پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری

سعید امین زاده

پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری

علی اصغر کارخانه

پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Parmjit S. (2010). Potential application of immobilized 8-galactosidase in food ...
  • Wei Zhao. (2013). Preparation of Novel Poly (hydroxyethyl methacryl ate-coglycidyl ...
  • Fabiano Jares Contesini. (2013). Potential Applications of Carbohydrases Immobilization in ...
  • Harry Chaing. (2013). Biochem mol biol molecular mechanics and dynamics ...
  • Shoba Ranganathan. (2011). Towards big data science in the decade ...
  • Arthur W Toga. (2012). The Center for Computational Biology: resources, ...
  • Hein J Wijma. (2013). Structur -and sequence- analysis inspired engineering ...
  • Marc Robins on-Rechavi. (2006). Contribution of Elecrostatic interaction, pactness and ...
  • Euiyoung Bae. (2008). Bioinformatic method for protein thermal stabilization by ...
  • Rdova -sintiago TC. (2012). Human sertonin 5-HT2C G protein- coupled ...
  • Song D. (2013). homology modeling and docking studeies of Bj ...
  • Kaur J.(2013). A L-Lysin transporter of high S tereoselectivity of ...
  • RP Jedrzejewski. (2013). structure of patt1 human proapoptotic Histon Transferase. ...
  • Xie HB. (2013). Some insights into the binding mechanism of ...
  • SWIS S-MODEL: an automated protein ho mology- modeling Server. (2003) ...
  • Chih-chieh chen. (2006). (PS)2: protein structure prediction server. Nucleic Acides ...
  • Kelley LA and Sternberg MJE. Protein structure prediction on the ...
  • Kevin Karplus. (2009). SAM-T08, HMM-based protein structure prediction. Nucleic Acides ...
  • Pascal Benkert etal. (2011). Toward the estimation of the absolute ...
  • markus Wiederstein. (2007). Prosa-web: interactive we) service for the recognition ...
  • Wass MN.(2008). 3DLigandSite: predicting ligand-binding sites using similar structures. Nucleic ...
  • Ibrahim Torktaz. etal. (2013). Virtual screening and pharmacophore design for ...
  • korb O. etal. (2009). Empirical scoring functional for advanced protein- ...
  • Yves Dehouck. etal. (2009). Fast and accurate prediction of protein ...
    • نمایش کامل مراجع