یافتن توالی تکراری کوتاهTAAAAدر اینترون اول ژنP53 باکمک مطالعات بیوانفورماتیکی و ارتباط آن با سرطان پستان

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 547

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0431

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

سرطان پستان شایع ترین سرطان زنان در سراسر جهان می باشد. عوامل ژنتیکی متفاوتی در بروز سرطان پستان دخالت دارند. موتاسیون در ژنP53 ژن کد کننده سرکوب کننده تومورP53 در 50 درصد از سرطان های انسان از جمله سرطان پستان دخالت دارد. در ادامه ی آسیبP53 ،DNAفرایندهای کلیدی نظیر ترمیمDNAتوقف چرخه سلولی ، پیری و آپوپتوز را به منظور سرکوب تومور کنترل میکند. هدف این مطالعه یافتن یک توالی تکراری کوتاهSTRدراینترون ااول ژن P53 به وسیله مطالعات بیوانفورماتیکی و ارتباط آن باسرطان پستان می باشد. چندین پایگاه اطلاعاتی شامل Microsatellite repeats finder وEnsembl ،NCBIبه منظور یافتن توالی اینترون اول ژنP53 ونشانگرهای پلی مورفیک در اینترون اول ژنP53 استفاده شدند و سپس پرایمرهای مورد نظر به وسیله نرم افزارهایoligo و Primer3 ،SGDطراحی شدند. در میان توالی های کوتاه تکراری ، توالیTAAAAانتخاب شد و پرایمرها برای این نشانگر طراحی شدند. با کمک پایگاه های اطلاعاتیNCBI و Bioinformaticsپرایمرها بررسی شدندDNAژنومی از خون 203 فرد مبتلا به سرطان پستان و 200 فرد سالم در بین زنان اصفهانی به روشSalting outاستخراج شد و سپس توالی مورد نظر با روشPCRدر حجم 25 ماکرولیتر ( 33 سیکل) تکثیر یافت. آلل هایی با تکرارهای متفاوتTAAAAدر بین افراد شاهد و بیمارمشاهده شد. فراوانی آلل 10 تکرار در بین بیماران بیشتر از افراد شاهد بود. یافته های ما نشان داد افرادی که برای آلل 7 تکرار هموزیگوت هستند دارای ریسک بالاتری برای ابتلا به سرطان پستان می باشند

نویسندگان

سمیه نجفی درچه

گروه زیست شناسی، دانشکده ی علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران

منوچهر توسلی

گروه زیست شناسی، دانشکده ی علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران

سیمین همتی

گروه پرتودرمانی، دانشکده ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران