تعیین ترادف ژن پروتئین پوششی جدایههای ویروس موزائیک خیار از استان ایلام و بررسی موقعیت فیلوژنتیکی آن
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 710
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_0380
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
چکیده مقاله:
ویروس موزائیک خیارCucumber mosaic virus-CMVاز جنسCucumovirusیکی از ویروسهای دارای تنوع ژنتیکی و با دامنه میزبانی وسیع میباشد. داشتن اطلاعات کافی از تنوع ژنتیکی جدایههای شایع در هر منطقه از پیشنیازها جهت موفقیت در انتخاب واصلاح ارقام زراعی مقاوم در برابر آلودگی این ویروس محسوب میشود. با توجه به اهمیت زراعت گوجهفرنگی (یکی از میزبانهای مهماین ویروس) در استان ایلام، در این بررسی تعداد 53 نمونه برگی با علائم موزائیک، پیسک و بدشکلی برگ از مزارع گوجهفرنگی استان فوق جمعآوری و از نظر آلودگی بهCMVبا استفاده از آنتیبادی اختصاصی به روش الایزا مورد آزمون قرار گرفتند. سه نمونهD2S2,Sh4S و 2 I3S1که در آزمون الایزا واکنش مثبت داشتند، انتخاب و بکمک روشRT-PCRو بکارگیری آغازگرهای اختصاصی، ناحیه ژن پروتئین پوششیCPویروسCMVتکثیر و تعیین توالی شد. طول توالی کامل نوکلئوتیدی ژنCPاین سه جدایه 657 نوکلئوتید بود که یک پروتئین فرضی بطول 218 اسیدآمینه کد مینماید. سه توالی بدست آمده با توالیCPمربوط به 46 دیگر جدایهCMVثبت شده دربانک ژن، مورد مقایسه قرار گرفتند. در درخت تبارزایی رسم شده به روشNJدو گروه اصلی با تکرارپذیری بالا مشاهده شد که گروهI خود به دو زیرگروهIB و IAقابل تفکیک بود. هر سه جدایه ایرانی مورد بررسی در این تحقیق، بهمراه برخی دیگر جدایههای ایرانی این ویروس در زیرگروهIAو تعدادی دیگر از جدایههای ایرانیCMV از خوزستان و هرمزگان) در زیرگروهIBقرار گرفتند. بررسی درصدیکنواختی توالی نوکلئوتیدی ژنCPنشان دهنده وجود درصد یکنواختی بالای 90 درصد بین سه جدایه ایرانی مورد مطالعه با دیگر جدایه های این ویروس بود. این اولین مطالعه روی تنوع ژنتیکی جدایههایCMVو گزارش وقوع زیرگروهIA این ویروس دراستان ایلام می باشد
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سعیده امیراولاد
گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام
رضا پوررحیم
بخش تحقیقات ویروسشناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، تهران
شیرین فرزادفر
بخش تحقیقات ویروسشناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، تهران
خشنود نوراللهی
گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :