آنالیز توالی ژن2A جدایه ایرانی ویروس موزائیک آرابیس از گیاه جو
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 723
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_0372
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
چکیده مقاله:
ویروس موزائیک آرابیس ArMVاز جمله عوامل مهم بیمارگر در تعدادی از جنسهای گیاهی میباشد. در بازدیدی از مزارع جو استان سمنان در سالهای 1390-1392 ، تعدادی نمونه جو با علائم سبزردی و کاهش نسبی رشد مشاهده شد. این نمونهها در آزمون الایزا، با آنتی بادی اختصاصی ویروسArMVدارای واکنش مثبت بودند. مایهزنی این نمونهها روی گیاهان محک موجب بروز علائم لکههای سبزرد وسپس پیسک سیستمیک درCh. amaranticolor و Chenopodium quinoaو لکههای سبزرد و متعاقبا سبزردی سیستمیک و کاهش رشددرCucumis sativusشد. با استفاده از آزمونRT-PCRو بکمک آغازگرهای اختصاصی، ژن پروتئین2Aدر دو جدایه ایرانیArMV بدست آمده از گیاهان جوBar.S1 و 2 Bar.Sتکثیر و تعیین توالی شد. طول توالی نوکلئوتیدی ژن2Aجدایههای ایرانی 810 نوکلئوتید بود که پروتئین فرضی به طول 270 اسید آمینه را کد مینماید. میزان یکنواختیidentityتوالی بین دو جدایه ایرانی95/2درصد تعیین گردید. بیشترین میزان یکنواختی با جدایهGQ369529از جو (از سوئیس) تعیین گردید. بر اساس آنالیز نبارزایی به روشNJجدایههایاین ویروس به سه گروه اصلیGIII و GII ،GIتقسیم شدند. بیشتر جدایههای اروپایی این ویروس در گروه I خود شامل 5 زیرگروه قرار گرفته و دو جدایه ژاپنی در گروهIIو دو جدایه ایرانیBar.S1 2 Bar.S به همراه جدایههایی از ژاپن، سوئیس و نیوزلند در گروه IIIگرفتند. این اولین مطالعه در مورد خصوصیات ژن2Aجدایههای ایرانی ویروس موزائیک آرابیس و نیز اولین گزارش از وقوع آلودگی به این ویروس در مزارع جو کشور میباشد
نویسندگان
رضا پوررحیم
بخش تحقیقات ویروسهای گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، ص.پ. ۱۴۵۴-۱۹۳۹۵، تهران
شیرین فرزادفر
بخش تحقیقات ویروسهای گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، ص.پ. ۱۴۵۴-۱۹۳۹۵، تهران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :