آنالیز ژن پروتئین پوششی جدایههای ایرانی ویروس پیچیدگی شلغم

ویروس پیچیدگی شلغمTurnip curly top virus-TCTV)از اعضای جنس کورتوویروس از خانواده جیمنیویریده میباشد. این ویروس موجب بروز بیماری در برخی از گونههای زراعی و وحشی جنس براسیکا میشود. در بررسی بعمل آمده در سال 1392 تعدادی نمونهعلف هرز ترب وحشی با علائم بازماندند از رشد و پیچیدگی شدید برگ از استان تهران جمعآوری شده و احتمال آلودگی آنها به ویروسTCTVبا استفاده از روش پی.سی.آر و بکمک آغازگرهای اختصاصی طراحی شده برای تکثیر ناحیه ژن پروتئین پوششیTCTV (CP)مورد بررسی قرار گرفت. توالی قطعه دی.ان.ای تکثیر یافته طی آزمون پی.سی.آر تعیین شد. نتایج حاصل نشان داد که ژنCPجدایه ایرانی TCTV-Rapاز تربوحشیRaphanus raphanistrum 831 نوکلئوتید تشکیل شده که یک پروتئین فرضی بطول حدود 276 اسیدآمبنه را کد مینماید. جمعیت TCTVدر ایران به چهارر زیر جمعیتA,B,C,D تقسیم میگردد. بررسی آنالیز تنوعزحدر جمعیت جدایههای ایرانی این ویروس به روشKimura two parameterنشان داد که میزان تنوع کلی در این جمعیت0/072است. این اولین گزارش ازآنالیز توالی ژن پروتئین پوششی جدایههای این ویروس از میزبان علف هرز ترب وحشی در ایران میباشد.

کلیدواژه ها:

جمینیویروس ، تنوع ژنتیکی ، ترب وحشی