پیش بینی بیوانفورماتیکی پروتئین های قابل شناسایی بوسیله -γ کربوکسیلاز حشره دروزوفیلا

گاما کربوکسیلاسیون برای فعالیت بیولوژیک بسیاری از پروتئین ها از جمله فاکتورهای انعقادی ضروری است. کربوکسیلاسیون که در محل اسیدآمینه های گلوتامیک و بوسیله آنزیم گاما کربوکسیلاز انجام می شود، نیاز به حضور یک جایگاه تشخیصγ-CRSدارد کهمعمولا درون یک پروپپتید 12 تا 28 اسید آمینه ای قرار دارد. این آنزیم در مهره داران و همچنین در 2 بی مهره شامل دروزوفیلاملانوگاستر وMolluscsمتعلق به جنس(Cone snail) Conusیافت شده است ولیCone snailتنها بی مهره ای است که گاماکربوکسیلاز و سوبسترای مربوطه در آن مشخص شده است. هر چند که سوبستراهای طبیعی آنزیم گاما کربوکسیلاز دروزوفیلایی تاکنون مشخص نشده است اما این آنزیم می تواند پروپپتید فاکتور 9 و پروترومبین را شناسایی و آنها را کربوکسیله کند. لذا یک توالی اجمالی براساسE-motifاز روی پروتئین های گلای پستانداران ساخته شده که بر اساس آن پروتئین های پستاندران واجد ناحیه گلا در آن قابل تشخیص هستند. جستجوی بانک اطلاعاتی ژنوم دروزوفیلا با استفاده از این موتیف هیچ پروتئینی واجد ناحیه گلای را آشکار ننمود.همچنین بانک اطلاعاتی ژنوم دروزوفیلا براساس پروپپتید پستانداران و توالی اجمالی پروپپتید جستجو شد که هیچ پروتئین واجد گلایی راآشکار نساخت. در نهایت جستجو در ژنوم دروزوفیلا با استفاده از تک تک توالی پروپپتیدی 17 پروتئین گلای حلزون حلقوی منجر به آشکارسازی حدود 75 پروتئین در گونه های مختلف دروزوفیلا شد. از میان پروتئین های آشکار شده، وجود و موقعیت ناحیه گلا در انتهای آمینی 9 پروتئین آشکار گردید.

کلیدواژه ها:

دروزوفیلا ، گاما کربوکسیلاز ، پروپپتید ، فاکتورهای انعقادی